More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0837 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
759 aa  1548    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  30.87 
 
 
756 aa  300  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.86 
 
 
738 aa  237  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  29.52 
 
 
734 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.16 
 
 
750 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.97 
 
 
737 aa  223  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  27.97 
 
 
710 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.01 
 
 
758 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.87 
 
 
758 aa  213  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.47 
 
 
756 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.34 
 
 
788 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.74 
 
 
778 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 
772 aa  207  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 
755 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
748 aa  197  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.86 
 
 
739 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.85 
 
 
782 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 
753 aa  190  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
750 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 
745 aa  184  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.03 
 
 
776 aa  183  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.56 
 
 
764 aa  181  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
738 aa  181  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.38 
 
 
756 aa  181  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.71 
 
 
872 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
751 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
731 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.61 
 
 
789 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.85 
 
 
726 aa  168  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 
704 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.01 
 
 
743 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.35 
 
 
771 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.35 
 
 
789 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.07 
 
 
779 aa  157  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.2 
 
 
720 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.18 
 
 
756 aa  154  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  28.07 
 
 
715 aa  152  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
730 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.82 
 
 
711 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.28 
 
 
770 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 
776 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.92 
 
 
790 aa  145  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
734 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.96 
 
 
734 aa  144  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  28.19 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 
737 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.28 
 
 
708 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.98 
 
 
491 aa  141  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  23.46 
 
 
753 aa  140  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 
701 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.24 
 
 
749 aa  136  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.43 
 
 
734 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
785 aa  134  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.69 
 
 
769 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.95 
 
 
820 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.28 
 
 
790 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  27.36 
 
 
742 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.61 
 
 
527 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.29 
 
 
774 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 
784 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 
743 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  25.9 
 
 
763 aa  127  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 
804 aa  125  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.5 
 
 
779 aa  125  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.21 
 
 
739 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 
731 aa  123  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.05 
 
 
720 aa  120  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.49 
 
 
733 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.3 
 
 
797 aa  119  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 
696 aa  118  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.62 
 
 
772 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  21.68 
 
 
727 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.16 
 
 
722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.64 
 
 
745 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.72 
 
 
721 aa  114  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  24.69 
 
 
572 aa  112  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.66 
 
 
729 aa  112  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
595 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
724 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.78 
 
 
747 aa  111  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.17 
 
 
741 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.18 
 
 
727 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
737 aa  110  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  23.67 
 
 
766 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  24.49 
 
 
572 aa  109  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
467 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
766 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.44 
 
 
466 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.22 
 
 
742 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.68 
 
 
709 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  26.15 
 
 
735 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23 
 
 
741 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23 
 
 
741 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  25.22 
 
 
764 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.03 
 
 
741 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.03 
 
 
741 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.03 
 
 
741 aa  108  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.88 
 
 
496 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.03 
 
 
724 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.65 
 
 
741 aa  107  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>