More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2592 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 790 aa  1582    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.6 
 
 		 745 aa  298  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  30.32 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  30.21 
 
 		 758 aa  287  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  30.07 
 
 		 758 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.34 
 
 		 739 aa  272  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.04 
 
 		 748 aa  269  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  29.93 
 
 		 756 aa  260  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  28.53 
 
 		 772 aa  258  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  30.18 
 
 		 778 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  28.63 
 
 		 782 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 764 aa  245  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 750 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 		 776 aa  233  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.15 
 
 		 751 aa  227  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.97 
 
 		 779 aa  227  8e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.22 
 
 		 788 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.49 
 
 		 756 aa  208  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 785 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.29 
 
 		 789 aa  190  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.1 
 
 		 755 aa  181  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.41 
 
 		 750 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  26.7 
 
 		 789 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  26.7 
 
 		 771 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.43 
 
 		 756 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.88 
 
 		 743 aa  161  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.75 
 
 		 738 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.32 
 
 		 734 aa  157  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 		 753 aa  156  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 		 737 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 696 aa  151  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 		 756 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 738 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.38 
 
 		 872 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 		 710 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.74 
 
 		 701 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.69 
 
 		 726 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.26 
 
 		 770 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 759 aa  132  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.34 
 
 		 729 aa  129  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.68 
 
 		 711 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 731 aa  127  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 704 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 491 aa  126  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.7 
 
 		 745 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 776 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  28.32 
 
 		 713 aa  122  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 		 797 aa  122  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 707 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  25.22 
 
 		 688 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  27.53 
 
 		 715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  25.66 
 
 		 472 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.21 
 
 		 741 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.44 
 
 		 779 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.57 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  28.25 
 
 		 763 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 718 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  23.69 
 
 		 720 aa  108  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 		 536 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  27.91 
 
 		 742 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 595 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.1 
 
 		 737 aa  106  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 		 721 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  21.42 
 
 		 772 aa  105  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.87 
 
 		 727 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 726 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.02 
 
 		 733 aa  104  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.3 
 
 		 739 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.17 
 
 		 737 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.89 
 
 		 747 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 766 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 		 720 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.92 
 
 		 720 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.18 
 
 		 722 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3133  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 588 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4548  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.17 
 
 		 554 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  22.47 
 
 		 709 aa  99.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.48 
 
 		 461 aa  99  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 724 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  24.65 
 
 		 764 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  25.61 
 
 		 773 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 588 aa  98.2  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 749 aa  97.4  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 735 aa  96.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 804 aa  95.5  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 759 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  26.77 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  23.71 
 
 		 741 aa  95.9  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  21.28 
 
 		 572 aa  95.5  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  21.28 
 
 		 572 aa  95.1  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>