178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4605 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  62.55 
 
 
715 aa  903    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.97 
 
 
784 aa  870    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  63.01 
 
 
773 aa  926    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  66.58 
 
 
742 aa  900    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  61.64 
 
 
769 aa  900    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  64.09 
 
 
713 aa  907    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  100 
 
 
763 aa  1506    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.17 
 
 
774 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.92 
 
 
737 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 
766 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.31 
 
 
804 aa  369  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.31 
 
 
804 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  35.24 
 
 
709 aa  361  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  36.01 
 
 
735 aa  357  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.07 
 
 
759 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  33.29 
 
 
747 aa  338  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.23 
 
 
726 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  35.06 
 
 
720 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.97 
 
 
724 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  32.36 
 
 
738 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.72 
 
 
756 aa  195  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.8 
 
 
734 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.91 
 
 
491 aa  171  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  27.98 
 
 
758 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.26 
 
 
756 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  27.27 
 
 
758 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 
748 aa  157  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 
745 aa  154  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  27.93 
 
 
688 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
764 aa  144  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.98 
 
 
772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  26.57 
 
 
788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.29 
 
 
778 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.18 
 
 
753 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 
701 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.52 
 
 
739 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.12 
 
 
711 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.92 
 
 
782 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  27.45 
 
 
764 aa  131  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.04 
 
 
756 aa  129  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
704 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
750 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.82 
 
 
756 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 
750 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  28.25 
 
 
687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 
537 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  28.01 
 
 
790 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 
696 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.6 
 
 
743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
759 aa  116  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.28 
 
 
776 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 
478 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 
731 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.58 
 
 
779 aa  111  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 
731 aa  110  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  27.08 
 
 
472 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.02 
 
 
737 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.17 
 
 
753 aa  109  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.51 
 
 
726 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 
707 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.37 
 
 
797 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
707 aa  107  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
718 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.09 
 
 
872 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  28.25 
 
 
729 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
467 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.96 
 
 
710 aa  100  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 
779 aa  99  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2874  lipopolysaccharide biosynthesis  27.08 
 
 
515 aa  99.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.61 
 
 
789 aa  98.2  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  25.63 
 
 
466 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 
751 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.88 
 
 
772 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.19 
 
 
755 aa  95.9  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  22.7 
 
 
771 aa  95.1  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
595 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
730 aa  95.1  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  22.7 
 
 
789 aa  95.1  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
730 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  20.26 
 
 
738 aa  90.5  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
776 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  27.17 
 
 
572 aa  87  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.05 
 
 
737 aa  87  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  27.29 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  21.52 
 
 
770 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.18 
 
 
731 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.1 
 
 
461 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 
466 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0359  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  25.62 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.302004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 
749 aa  80.5  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.12 
 
 
733 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.19 
 
 
774 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  23.57 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.53 
 
 
737 aa  76.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
735 aa  77  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.22 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.75 
 
 
745 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>