More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1073 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  58.3 
 
 
738 aa  911    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
755 aa  1550    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  42.86 
 
 
756 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  38.54 
 
 
737 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  35.21 
 
 
770 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  35.18 
 
 
731 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  33.78 
 
 
726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  37.77 
 
 
527 aa  320  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 
730 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.11 
 
 
753 aa  283  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.46 
 
 
756 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.79 
 
 
734 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.17 
 
 
738 aa  267  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.08 
 
 
743 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 
756 aa  256  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  29.29 
 
 
872 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.74 
 
 
797 aa  251  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.5 
 
 
721 aa  249  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  28.01 
 
 
708 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.08 
 
 
779 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.95 
 
 
727 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
745 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 
745 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
710 aa  234  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.61 
 
 
753 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.21 
 
 
772 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
710 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.76 
 
 
711 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.68 
 
 
778 aa  222  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.41 
 
 
756 aa  220  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 
710 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.37 
 
 
758 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 
774 aa  213  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.37 
 
 
737 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 
750 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.39 
 
 
739 aa  211  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.81 
 
 
788 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.59 
 
 
758 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  26.2 
 
 
789 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.91 
 
 
734 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 
710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  26.36 
 
 
771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 
804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  26.47 
 
 
789 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 
790 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.22 
 
 
739 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 
782 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.41 
 
 
741 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.13 
 
 
741 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.13 
 
 
741 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.13 
 
 
741 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.06 
 
 
741 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.62 
 
 
720 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
759 aa  187  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.97 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
733 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  26.24 
 
 
741 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
748 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  27.24 
 
 
739 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  27.24 
 
 
739 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  25.1 
 
 
790 aa  181  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.6 
 
 
741 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.06 
 
 
739 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.43 
 
 
732 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.8 
 
 
740 aa  177  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.58 
 
 
722 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  30.3 
 
 
746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.46 
 
 
746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.2 
 
 
806 aa  174  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
764 aa  173  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  34.16 
 
 
466 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.55 
 
 
722 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  30.55 
 
 
750 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  24.74 
 
 
721 aa  172  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.65 
 
 
741 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.82 
 
 
747 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.25 
 
 
779 aa  171  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 
742 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.94 
 
 
745 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  28.76 
 
 
746 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  24.44 
 
 
776 aa  169  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.43 
 
 
763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  29.89 
 
 
508 aa  168  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  25.7 
 
 
744 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.56 
 
 
730 aa  167  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 
750 aa  167  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25 
 
 
734 aa  167  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 
750 aa  167  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  24.19 
 
 
719 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  24.09 
 
 
719 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  24.53 
 
 
719 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.06 
 
 
720 aa  164  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  24.1 
 
 
723 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  23.76 
 
 
719 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  33.64 
 
 
521 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  23.7 
 
 
794 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 
755 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.26 
 
 
505 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  24 
 
 
766 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>