More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2982 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  100 
 
 
758 aa  1546    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  95.38 
 
 
758 aa  1431    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.17 
 
 
764 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  41.01 
 
 
776 aa  549  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  40.21 
 
 
778 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  40.18 
 
 
788 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.13 
 
 
739 aa  479  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  35.19 
 
 
772 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.86 
 
 
745 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  35.18 
 
 
789 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  36.81 
 
 
753 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  35.6 
 
 
756 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  35.64 
 
 
782 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.67 
 
 
748 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.05 
 
 
779 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  35.08 
 
 
771 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  35.05 
 
 
789 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.7 
 
 
750 aa  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  30.71 
 
 
756 aa  330  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  30.07 
 
 
790 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
751 aa  292  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.53 
 
 
734 aa  289  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  30 
 
 
750 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28.5 
 
 
710 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 
785 aa  253  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27 
 
 
756 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.26 
 
 
730 aa  247  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.24 
 
 
738 aa  243  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
737 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.7 
 
 
743 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 
731 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.03 
 
 
738 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.03 
 
 
756 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.83 
 
 
726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
759 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.64 
 
 
755 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 
753 aa  210  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.97 
 
 
779 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 
770 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.75 
 
 
701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 
728 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
776 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 
872 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.17 
 
 
772 aa  181  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.21 
 
 
711 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.99 
 
 
745 aa  180  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  26.44 
 
 
737 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 
721 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  29.75 
 
 
773 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  28.87 
 
 
715 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
491 aa  161  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  28.92 
 
 
713 aa  161  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.81 
 
 
727 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.27 
 
 
790 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
784 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  29.78 
 
 
763 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
804 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 
704 aa  154  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  28.7 
 
 
742 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  28.89 
 
 
769 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
696 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  25.05 
 
 
572 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
733 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  24.56 
 
 
527 aa  147  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  24.84 
 
 
572 aa  147  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 
766 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  24.72 
 
 
735 aa  143  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.47 
 
 
724 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
734 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 
734 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  23.16 
 
 
688 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.62 
 
 
742 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.11 
 
 
741 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  28.43 
 
 
764 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.21 
 
 
797 aa  138  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.73 
 
 
734 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
595 aa  138  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  24.57 
 
 
718 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.45 
 
 
496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.43 
 
 
741 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.43 
 
 
741 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.43 
 
 
741 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  21.74 
 
 
750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 
707 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.98 
 
 
741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.55 
 
 
707 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.71 
 
 
722 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 
724 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  26.9 
 
 
737 aa  134  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 
743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.9 
 
 
736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 
774 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.18 
 
 
806 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.68 
 
 
464 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  22.21 
 
 
739 aa  130  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
774 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 
737 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6092  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 
730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666238  decreased coverage  0.00184203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 
804 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>