More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3243 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 
722 aa  1478    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.78 
 
 
720 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.19 
 
 
739 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.72 
 
 
721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
730 aa  201  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
731 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.84 
 
 
797 aa  182  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
737 aa  181  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.2 
 
 
770 aa  180  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.75 
 
 
779 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
755 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.64 
 
 
726 aa  174  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.12 
 
 
772 aa  174  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
753 aa  173  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 
756 aa  173  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.58 
 
 
743 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.39 
 
 
737 aa  167  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.7 
 
 
720 aa  164  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.8 
 
 
711 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.02 
 
 
722 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
738 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.26 
 
 
742 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.71 
 
 
745 aa  158  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 
738 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
804 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  22.84 
 
 
756 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.33 
 
 
710 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.37 
 
 
734 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  23.96 
 
 
734 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.99 
 
 
766 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.57 
 
 
756 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  22.87 
 
 
774 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.65 
 
 
790 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  22.95 
 
 
727 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  24.31 
 
 
734 aa  140  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.76 
 
 
727 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.8 
 
 
733 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.38 
 
 
720 aa  140  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.64 
 
 
736 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  23.24 
 
 
757 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  23.83 
 
 
802 aa  135  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.26 
 
 
790 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.93 
 
 
736 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.66 
 
 
740 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.07 
 
 
454 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.87 
 
 
758 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 
745 aa  134  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.62 
 
 
720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.87 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.58 
 
 
758 aa  132  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.87 
 
 
741 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.62 
 
 
720 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.18 
 
 
732 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.79 
 
 
720 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.69 
 
 
815 aa  131  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.45 
 
 
720 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.82 
 
 
719 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.82 
 
 
719 aa  131  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.45 
 
 
720 aa  131  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.82 
 
 
719 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  26.82 
 
 
719 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.45 
 
 
720 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.61 
 
 
739 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.82 
 
 
719 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.72 
 
 
741 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.75 
 
 
872 aa  129  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.13 
 
 
741 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.28 
 
 
720 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.28 
 
 
720 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.06 
 
 
464 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.83 
 
 
741 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.83 
 
 
741 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.83 
 
 
741 aa  127  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.07 
 
 
230 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  25.46 
 
 
803 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.07 
 
 
230 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.91 
 
 
739 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.76 
 
 
750 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.93 
 
 
527 aa  125  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.91 
 
 
739 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 
710 aa  125  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  22.54 
 
 
784 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  33.19 
 
 
747 aa  125  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.83 
 
 
741 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.91 
 
 
739 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.12 
 
 
217 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  27.19 
 
 
736 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 
472 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.16 
 
 
806 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  22.67 
 
 
753 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  22.71 
 
 
756 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.62 
 
 
730 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35.12 
 
 
217 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  22.82 
 
 
746 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.94 
 
 
741 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  22.82 
 
 
746 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.01 
 
 
782 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  22.99 
 
 
746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  23.26 
 
 
776 aa  120  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>