More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1086 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  48.19 
 
 
751 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  56.02 
 
 
744 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  52.45 
 
 
746 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  54.88 
 
 
736 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  100 
 
 
734 aa  1473    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  53.4 
 
 
736 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  55.6 
 
 
744 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  55.34 
 
 
741 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  45.48 
 
 
746 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  43.19 
 
 
740 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  45.72 
 
 
745 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  45.85 
 
 
745 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  44.87 
 
 
745 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  43.67 
 
 
747 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  44.73 
 
 
745 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  43.17 
 
 
750 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  44.24 
 
 
746 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  44.68 
 
 
747 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  44.51 
 
 
747 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  46.12 
 
 
747 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  44.43 
 
 
746 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  43.59 
 
 
755 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  44.57 
 
 
746 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  40.45 
 
 
744 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  43.86 
 
 
746 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  42.76 
 
 
748 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  44.43 
 
 
746 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  42.56 
 
 
730 aa  555  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  43.23 
 
 
764 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  42.3 
 
 
740 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  39.8 
 
 
747 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  43.37 
 
 
755 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  39.78 
 
 
739 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  39.64 
 
 
739 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  41.92 
 
 
740 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  42.44 
 
 
749 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  39.64 
 
 
739 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  41.62 
 
 
740 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  39.5 
 
 
739 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.08 
 
 
741 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  39.17 
 
 
741 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  40.08 
 
 
741 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  40.08 
 
 
741 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  40.9 
 
 
753 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.53 
 
 
741 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  39.64 
 
 
759 aa  515  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  40.08 
 
 
764 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  41.58 
 
 
734 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.03 
 
 
741 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  39.39 
 
 
741 aa  515  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  41.2 
 
 
757 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  38.17 
 
 
721 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.44 
 
 
726 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  40.4 
 
 
735 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  40.12 
 
 
726 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  38.72 
 
 
723 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  39.39 
 
 
732 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  37.17 
 
 
720 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  38.97 
 
 
723 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  37.38 
 
 
719 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  40 
 
 
755 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  37.17 
 
 
720 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  37.31 
 
 
720 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  39.06 
 
 
740 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  37.17 
 
 
720 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.45 
 
 
730 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  37.59 
 
 
719 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  37.17 
 
 
720 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  37.31 
 
 
720 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  36.9 
 
 
720 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  41.68 
 
 
754 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  37.45 
 
 
719 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  37.04 
 
 
720 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  37.45 
 
 
719 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  37.45 
 
 
719 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3622  hypothetical protein  39.03 
 
 
760 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  38.02 
 
 
724 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4097  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.83 
 
 
760 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139817  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  39.11 
 
 
745 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.35 
 
 
736 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  37 
 
 
716 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  35.79 
 
 
720 aa  475  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  37.11 
 
 
726 aa  463  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  37.11 
 
 
726 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  463  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  37.11 
 
 
726 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  36.87 
 
 
727 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  37 
 
 
722 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  36.83 
 
 
731 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  35.98 
 
 
724 aa  445  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  35.21 
 
 
726 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  34.69 
 
 
802 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  37 
 
 
721 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  37.83 
 
 
733 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  33.74 
 
 
784 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.15 
 
 
730 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>