More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3034 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  785    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  57.71 
 
 
720 aa  850    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  57.58 
 
 
720 aa  848    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  54.14 
 
 
726 aa  784    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  58.21 
 
 
719 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  55.96 
 
 
727 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  58.07 
 
 
719 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  82.55 
 
 
724 aa  1191    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  100 
 
 
723 aa  1476    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  46.2 
 
 
726 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  57.71 
 
 
720 aa  850    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  57.58 
 
 
720 aa  849    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  57.85 
 
 
720 aa  852    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  57.71 
 
 
720 aa  850    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  58.21 
 
 
719 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  57.44 
 
 
720 aa  847    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  57.58 
 
 
720 aa  849    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  46.1 
 
 
726 aa  649    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  58.21 
 
 
719 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  51.41 
 
 
716 aa  721    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  71.88 
 
 
723 aa  1050    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  58.13 
 
 
720 aa  873    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  785    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  51.2 
 
 
721 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  54.14 
 
 
726 aa  785    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  54.14 
 
 
726 aa  785    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  58.21 
 
 
719 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  59.43 
 
 
724 aa  873    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  58.6 
 
 
722 aa  833    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  44.69 
 
 
740 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  44.58 
 
 
759 aa  608  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  44.2 
 
 
731 aa  608  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  42.19 
 
 
734 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  43.66 
 
 
735 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  42.95 
 
 
753 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  40.85 
 
 
751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.47 
 
 
736 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  37.81 
 
 
746 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  39.56 
 
 
745 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  39.15 
 
 
747 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  38.8 
 
 
746 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  38.62 
 
 
746 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  38.89 
 
 
734 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  38.77 
 
 
749 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  38.08 
 
 
730 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  37.33 
 
 
741 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  37.19 
 
 
739 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  37.38 
 
 
739 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.33 
 
 
741 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  37.47 
 
 
741 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.47 
 
 
741 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  37.47 
 
 
741 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  37.24 
 
 
739 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  37.38 
 
 
739 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.92 
 
 
741 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  36.78 
 
 
741 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  37.27 
 
 
746 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  38.92 
 
 
747 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  35.83 
 
 
744 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  37.12 
 
 
747 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  35.76 
 
 
736 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  37.54 
 
 
740 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  35.91 
 
 
736 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  37.58 
 
 
750 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  37.09 
 
 
747 aa  465  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.81 
 
 
730 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  36.43 
 
 
746 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  36.43 
 
 
746 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  36.43 
 
 
746 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  35.73 
 
 
740 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  35.1 
 
 
733 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  34.81 
 
 
732 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  36.15 
 
 
745 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  36.29 
 
 
745 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  36.36 
 
 
741 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  35.72 
 
 
745 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  35.61 
 
 
755 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  37.14 
 
 
755 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  36.35 
 
 
744 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  34.97 
 
 
740 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  35.62 
 
 
764 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  35.79 
 
 
744 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  34.7 
 
 
740 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  37.34 
 
 
721 aa  432  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  33.24 
 
 
748 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.08 
 
 
730 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  34.58 
 
 
764 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.02 
 
 
726 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  34.6 
 
 
754 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  32.64 
 
 
747 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  34.09 
 
 
745 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  31.27 
 
 
802 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  31.09 
 
 
784 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  29.95 
 
 
784 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  32.37 
 
 
722 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  32.43 
 
 
757 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  31.99 
 
 
755 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>