More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3844 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  47.42 
 
 
759 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  49.25 
 
 
753 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  49.51 
 
 
735 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  50.07 
 
 
734 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
740 aa  1500    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  44.84 
 
 
721 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  45 
 
 
723 aa  612  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  44.51 
 
 
731 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  44.65 
 
 
724 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  43.6 
 
 
719 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  43.6 
 
 
719 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  43.47 
 
 
727 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  43.33 
 
 
719 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  43.47 
 
 
719 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  42.92 
 
 
720 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  42.92 
 
 
720 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  43.05 
 
 
720 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  43.69 
 
 
723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  42.92 
 
 
720 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  43.92 
 
 
716 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  42.78 
 
 
720 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  43.68 
 
 
719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  42.92 
 
 
720 aa  582  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  42.5 
 
 
720 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  42.92 
 
 
720 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  42.78 
 
 
720 aa  580  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  42.28 
 
 
726 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.57 
 
 
736 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  42.93 
 
 
730 aa  560  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  41.54 
 
 
747 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  40.99 
 
 
745 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  41.32 
 
 
746 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  41.85 
 
 
722 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  41.2 
 
 
724 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  40.91 
 
 
726 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  41.55 
 
 
749 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  41.85 
 
 
734 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  39.56 
 
 
746 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.59 
 
 
741 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  39.56 
 
 
739 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.4 
 
 
741 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  39.15 
 
 
739 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  39.02 
 
 
741 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  39.4 
 
 
741 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.29 
 
 
741 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  39.02 
 
 
739 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  39.43 
 
 
741 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  39.4 
 
 
741 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  39.02 
 
 
739 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  38.49 
 
 
736 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  40.34 
 
 
754 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  40.08 
 
 
751 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  37.8 
 
 
736 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  38.24 
 
 
740 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.66 
 
 
730 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  37.95 
 
 
746 aa  482  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  39.39 
 
 
746 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  38.45 
 
 
732 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  36.39 
 
 
726 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  38.36 
 
 
746 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  38.49 
 
 
746 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  38.49 
 
 
746 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  38.78 
 
 
745 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  38.61 
 
 
745 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  40.19 
 
 
747 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  38.96 
 
 
747 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  38 
 
 
745 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  36.68 
 
 
741 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  36.52 
 
 
750 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  36.38 
 
 
748 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  37.05 
 
 
740 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  36.55 
 
 
747 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  36.87 
 
 
755 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  37.78 
 
 
764 aa  439  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  36.74 
 
 
740 aa  432  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  38.2 
 
 
755 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  36.4 
 
 
733 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  32.08 
 
 
802 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  37.42 
 
 
740 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.36 
 
 
780 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  34.11 
 
 
744 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  35.78 
 
 
757 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  33.61 
 
 
747 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  34.79 
 
 
781 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  36.8 
 
 
744 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.56 
 
 
780 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  34.47 
 
 
745 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  36.36 
 
 
744 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  37.69 
 
 
721 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  32.53 
 
 
784 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.82 
 
 
730 aa  396  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  32.94 
 
 
784 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  31.84 
 
 
764 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>