More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3310 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  44.32 
 
 
743 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
756 aa  1547    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  32.71 
 
 
711 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.18 
 
 
730 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  31.71 
 
 
774 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.01 
 
 
753 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  29.82 
 
 
779 aa  286  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.55 
 
 
737 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.43 
 
 
797 aa  278  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.09 
 
 
745 aa  273  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27.43 
 
 
755 aa  264  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  27.1 
 
 
726 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.36 
 
 
790 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
731 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  28.3 
 
 
772 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 
804 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  27.76 
 
 
721 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.22 
 
 
756 aa  237  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 
737 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.15 
 
 
727 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.57 
 
 
770 aa  230  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.15 
 
 
734 aa  227  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 
733 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  26.25 
 
 
872 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.47 
 
 
806 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.05 
 
 
734 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 
745 aa  218  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 
738 aa  216  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.64 
 
 
758 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.07 
 
 
758 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.15 
 
 
753 aa  212  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.91 
 
 
741 aa  212  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.77 
 
 
736 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.85 
 
 
756 aa  210  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.58 
 
 
756 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.57 
 
 
738 aa  208  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.4 
 
 
741 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.98 
 
 
741 aa  205  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 
741 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.21 
 
 
741 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.27 
 
 
788 aa  203  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.05 
 
 
740 aa  203  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.7 
 
 
742 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.21 
 
 
741 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.88 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.88 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.88 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.09 
 
 
739 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 
710 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.17 
 
 
739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.17 
 
 
739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  27.21 
 
 
776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.17 
 
 
739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  27.85 
 
 
732 aa  198  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29.77 
 
 
527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.83 
 
 
739 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.1 
 
 
454 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.49 
 
 
739 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.23 
 
 
750 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.2 
 
 
722 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.12 
 
 
726 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.55 
 
 
746 aa  191  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  26.48 
 
 
766 aa  190  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  27.17 
 
 
786 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.54 
 
 
720 aa  188  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  25.5 
 
 
763 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.82 
 
 
736 aa  187  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  26.02 
 
 
746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  26.02 
 
 
746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.55 
 
 
778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  25.66 
 
 
746 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  27.54 
 
 
802 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.8 
 
 
782 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
764 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.97 
 
 
747 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  28.18 
 
 
731 aa  183  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.2 
 
 
800 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  26.54 
 
 
746 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.05 
 
 
730 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  27.11 
 
 
759 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.81 
 
 
464 aa  180  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  27.15 
 
 
740 aa  178  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
748 aa  178  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  26.3 
 
 
753 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.07 
 
 
739 aa  177  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.04 
 
 
745 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  37.92 
 
 
496 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  27.69 
 
 
789 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  27.15 
 
 
740 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  26.98 
 
 
784 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  25.74 
 
 
803 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  25.96 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.26 
 
 
764 aa  174  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.18 
 
 
750 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  25.95 
 
 
803 aa  173  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 
735 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  30.05 
 
 
726 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.27 
 
 
746 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.25 
 
 
741 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.28 
 
 
524 aa  172  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>