More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4817 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 727 aa  1468    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  47.38 
 
 		 737 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.28 
 
 		 753 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  31.15 
 
 		 797 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  31.25 
 
 		 733 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  30.38 
 
 		 779 aa  301  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.35 
 
 		 745 aa  296  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  30.47 
 
 		 772 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.93 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 737 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.11 
 
 		 721 aa  251  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 		 755 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.14 
 
 		 711 aa  239  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  35.43 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.15 
 
 		 756 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.44 
 
 		 756 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.26 
 
 		 467 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 731 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  32.58 
 
 		 466 aa  220  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.62 
 
 		 726 aa  216  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.16 
 
 		 738 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.97 
 
 		 790 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.76 
 
 		 756 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 		 734 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 804 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.64 
 
 		 738 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.86 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.93 
 
 		 756 aa  185  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  26.47 
 
 		 739 aa  176  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.44 
 
 		 770 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.57 
 
 		 782 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.77 
 
 		 774 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 		 750 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.7 
 
 		 464 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.04 
 
 		 739 aa  174  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.97 
 
 		 750 aa  173  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.21 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.65 
 
 		 766 aa  170  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  27.54 
 
 		 742 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.63 
 
 		 806 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.84 
 
 		 734 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.76 
 
 		 741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.66 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.07 
 
 		 736 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 745 aa  164  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  41.18 
 
 		 232 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.52 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.41 
 
 		 872 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.52 
 
 		 726 aa  162  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.43 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.6 
 
 		 734 aa  160  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.77 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.07 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  34.77 
 
 		 503 aa  158  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.72 
 
 		 758 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.49 
 
 		 235 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.99 
 
 		 772 aa  157  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.73 
 
 		 496 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.41 
 
 		 758 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.2 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.8 
 
 		 739 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.12 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.83 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.05 
 
 		 575 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  29.24 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  29.24 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.05 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.55 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.71 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.28 
 
 		 726 aa  152  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.24 
 
 		 720 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  27.81 
 
 		 719 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.67 
 
 		 233 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25 
 
 		 744 aa  151  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.24 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.79 
 
 		 741 aa  151  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  27.55 
 
 		 719 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.79 
 
 		 741 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.3 
 
 		 454 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  27.55 
 
 		 719 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  27.55 
 
 		 719 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.27 
 
 		 463 aa  150  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.98 
 
 		 720 aa  150  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.98 
 
 		 720 aa  150  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.98 
 
 		 720 aa  150  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.99 
 
 		 741 aa  150  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.72 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.44 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  28.8 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  35.71 
 
 		 233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.77 
 
 		 740 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  30.09 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.09 
 
 		 741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>