More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3195 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 503 aa  1004    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  65.08 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  49.21 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  50.11 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  46.88 
 
 		 463 aa  346  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  42.92 
 
 		 667 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  43.88 
 
 		 615 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.29 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  41.42 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  40.05 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  43.05 
 
 		 438 aa  306  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  40.78 
 
 		 490 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  42.22 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  39.08 
 
 		 509 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  38.53 
 
 		 508 aa  290  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  37.65 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.4 
 
 		 496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  39.91 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.46 
 
 		 492 aa  279  8e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  38.34 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  39.76 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  41.38 
 
 		 443 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  41.55 
 
 		 473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.39 
 
 		 492 aa  229  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.13 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.19 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  36.41 
 
 		 453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  31.14 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  37.16 
 
 		 790 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.45 
 
 		 575 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  37.2 
 
 		 804 aa  186  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 730 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.51 
 
 		 482 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  43.96 
 
 		 235 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  35.21 
 
 		 257 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  40.09 
 
 		 225 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  39.64 
 
 		 225 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.74 
 
 		 217 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.74 
 
 		 217 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.35 
 
 		 721 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  40.09 
 
 		 225 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.19 
 
 		 225 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  32.92 
 
 		 727 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  43.14 
 
 		 232 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  38.74 
 
 		 225 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.58 
 
 		 753 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  41.2 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  31.88 
 
 		 743 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  38.36 
 
 		 233 aa  163  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  37.9 
 
 		 233 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  40.83 
 
 		 246 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  37.9 
 
 		 233 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  40.37 
 
 		 240 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  37.9 
 
 		 233 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  41.74 
 
 		 233 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  37.9 
 
 		 233 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.81 
 
 		 234 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.53 
 
 		 228 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.53 
 
 		 228 aa  161  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.73 
 
 		 230 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.73 
 
 		 230 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  32.37 
 
 		 794 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  41.28 
 
 		 224 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.64 
 
 		 756 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  35.23 
 
 		 763 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  35.41 
 
 		 722 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  33.11 
 
 		 806 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  32.24 
 
 		 539 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  38.74 
 
 		 795 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.16 
 
 		 741 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.7 
 
 		 732 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  34.27 
 
 		 783 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.43 
 
 		 736 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  37.32 
 
 		 730 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.16 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 		 798 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.92 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.92 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.92 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  30.7 
 
 		 740 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  39.9 
 
 		 802 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  34.41 
 
 		 750 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  40.83 
 
 		 239 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  37.94 
 
 		 733 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  36.7 
 
 		 221 aa  149  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.8 
 
 		 220 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  38.5 
 
 		 747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.67 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.21 
 
 		 741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.06 
 
 		 730 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  38.5 
 
 		 746 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 779 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  41.79 
 
 		 585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  32.93 
 
 		 815 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.79 
 
 		 741 aa  147  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  31.65 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  37.5 
 
 		 745 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  28.7 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.34 
 
 		 739 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  37.74 
 
 		 257 aa  146  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>