More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4185 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
473 aa  948    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  46.67 
 
 
509 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  44.54 
 
 
667 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  43.91 
 
 
615 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  41.16 
 
 
454 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  42.07 
 
 
505 aa  332  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  41.91 
 
 
496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  42.53 
 
 
508 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  43.58 
 
 
463 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  40.69 
 
 
466 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  42.53 
 
 
497 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  41.01 
 
 
490 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  42.63 
 
 
484 aa  300  5e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  41.11 
 
 
472 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  40.5 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  40.34 
 
 
503 aa  282  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  42.53 
 
 
525 aa  279  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  44.21 
 
 
443 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  36.16 
 
 
529 aa  246  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  34.44 
 
 
521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.13 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.53 
 
 
524 aa  233  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.98 
 
 
464 aa  229  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35.7 
 
 
477 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.38 
 
 
492 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  36.05 
 
 
438 aa  204  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.21 
 
 
492 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.86 
 
 
575 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.66 
 
 
453 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  37.13 
 
 
794 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  35.99 
 
 
804 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.92 
 
 
482 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  33.77 
 
 
790 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  43.01 
 
 
232 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.41 
 
 
217 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  33.03 
 
 
772 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.92 
 
 
217 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.85 
 
 
624 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.73 
 
 
736 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  30.61 
 
 
539 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  38.74 
 
 
225 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  38.7 
 
 
756 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  32.2 
 
 
786 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.46 
 
 
730 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  36.52 
 
 
795 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  34.42 
 
 
721 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  32.7 
 
 
257 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.9 
 
 
743 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  37.39 
 
 
225 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  36.94 
 
 
225 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  31.89 
 
 
783 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  40.72 
 
 
246 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.21 
 
 
235 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  34.09 
 
 
734 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  35.95 
 
 
763 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  40.38 
 
 
224 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  41.43 
 
 
233 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  34.43 
 
 
798 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  32.2 
 
 
741 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  32.58 
 
 
802 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.2 
 
 
741 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  37.44 
 
 
233 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  32.67 
 
 
745 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  31.89 
 
 
741 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  36.49 
 
 
225 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36.97 
 
 
233 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.52 
 
 
741 aa  153  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.58 
 
 
741 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  31.58 
 
 
741 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  31.58 
 
 
741 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  33.57 
 
 
775 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  36.97 
 
 
233 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.59 
 
 
225 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  36.97 
 
 
233 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  36.97 
 
 
233 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  31.31 
 
 
815 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.97 
 
 
234 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.51 
 
 
480 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.94 
 
 
720 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.89 
 
 
739 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.89 
 
 
739 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.33 
 
 
739 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  35.24 
 
 
217 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.43 
 
 
730 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  29.81 
 
 
726 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.23 
 
 
739 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  30.15 
 
 
740 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.15 
 
 
732 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  32.48 
 
 
742 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  39.42 
 
 
252 aa  144  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  30.55 
 
 
738 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  30.9 
 
 
746 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.58 
 
 
240 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  32.59 
 
 
711 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  33.83 
 
 
767 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  33.65 
 
 
221 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  30.04 
 
 
605 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  31.8 
 
 
740 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  28.69 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  32.72 
 
 
740 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>