More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0560 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 492 aa  988    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  62.01 
 
 		 239 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.91 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.97 
 
 		 667 aa  269  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  36.1 
 
 		 490 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.9 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.64 
 
 		 505 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.56 
 
 		 615 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.11 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  37.46 
 
 		 730 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  33.41 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  35.2 
 
 		 521 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.36 
 
 		 529 aa  217  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  35.31 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  52.02 
 
 		 253 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.73 
 
 		 482 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.34 
 
 		 217 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  45.85 
 
 		 217 aa  203  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.2 
 
 		 496 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.39 
 
 		 492 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  33.7 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.29 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  36.92 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.45 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.05 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.49 
 
 		 804 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  32.1 
 
 		 509 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  44.25 
 
 		 232 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  32.53 
 
 		 624 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  35.67 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  51.04 
 
 		 240 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  35.35 
 
 		 790 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.89 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  44.55 
 
 		 246 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  42.08 
 
 		 233 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.89 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  41.58 
 
 		 233 aa  177  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  42.08 
 
 		 233 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  42.08 
 
 		 233 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  32.53 
 
 		 741 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  41.58 
 
 		 233 aa  176  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 524 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.25 
 
 		 225 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  32.18 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.58 
 
 		 234 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  45.73 
 
 		 235 aa  174  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  32.62 
 
 		 745 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  39.25 
 
 		 225 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.7 
 
 		 736 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  35.92 
 
 		 743 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.19 
 
 		 225 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  39.37 
 
 		 221 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.1 
 
 		 257 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  39.25 
 
 		 225 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.8 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  35.76 
 
 		 753 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  46.01 
 
 		 224 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.41 
 
 		 756 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  39.25 
 
 		 225 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  32.52 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  42.5 
 
 		 211 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  46.01 
 
 		 233 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  29.39 
 
 		 726 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  35.91 
 
 		 733 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  35.51 
 
 		 774 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  43.9 
 
 		 242 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  32.67 
 
 		 525 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.62 
 
 		 741 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  29.17 
 
 		 806 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  30.36 
 
 		 469 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.3 
 
 		 737 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.48 
 
 		 722 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  36.76 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  30.43 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  31.59 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  32.53 
 
 		 720 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.31 
 
 		 230 aa  156  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.31 
 
 		 230 aa  156  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  32.52 
 
 		 724 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  30.89 
 
 		 742 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.2 
 
 		 215 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  32.4 
 
 		 723 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  33.78 
 
 		 746 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  33.71 
 
 		 749 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  38.42 
 
 		 217 aa  154  5e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  37.34 
 
 		 252 aa  154  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30 
 
 		 741 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  32.24 
 
 		 727 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30 
 
 		 741 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  32.19 
 
 		 719 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.19 
 
 		 719 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  33.45 
 
 		 766 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  32.19 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.99 
 
 		 720 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.54 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  30 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  32.19 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  31.34 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  36 
 
 		 257 aa  152  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  30.54 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>