More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1213 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 482 aa  974    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.97 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.29 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.2 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  28.02 
 
 		 492 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 		 508 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.59 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  26.76 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.16 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  28.32 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  25.98 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  28.6 
 
 		 525 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.6 
 
 		 492 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  26.82 
 
 		 667 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  30.84 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  45.74 
 
 		 249 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.29 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.11 
 
 		 490 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.94 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  26.91 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.67 
 
 		 474 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  32.04 
 
 		 741 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.26 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  30.97 
 
 		 804 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  40.39 
 
 		 246 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29.67 
 
 		 721 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.04 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 615 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  28.44 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  39.02 
 
 		 229 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.11 
 
 		 734 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  26.13 
 
 		 443 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  33.75 
 
 		 756 aa  157  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.48 
 
 		 745 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.04 
 
 		 736 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  37.73 
 
 		 230 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  30.38 
 
 		 755 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  40.95 
 
 		 217 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 		 730 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  30.3 
 
 		 753 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  41.94 
 
 		 217 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  28.48 
 
 		 756 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.47 
 
 		 217 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  35.81 
 
 		 233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.19 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 		 737 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  30.95 
 
 		 806 aa  147  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  39.9 
 
 		 232 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  27.09 
 
 		 473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.5 
 
 		 233 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  34.93 
 
 		 233 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  30.29 
 
 		 774 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  34.06 
 
 		 233 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  28.77 
 
 		 763 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  26.39 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  34.06 
 
 		 233 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  29.08 
 
 		 750 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  34.12 
 
 		 795 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.06 
 
 		 234 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  31.49 
 
 		 759 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.58 
 
 		 739 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  39.39 
 
 		 246 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.48 
 
 		 230 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  25.34 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.38 
 
 		 731 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  36.73 
 
 		 252 aa  139  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  29.9 
 
 		 726 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.75 
 
 		 741 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.27 
 
 		 227 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  37.8 
 
 		 225 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 		 726 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.9 
 
 		 575 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  31.52 
 
 		 815 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  29.09 
 
 		 742 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.12 
 
 		 727 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.15 
 
 		 225 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  33.33 
 
 		 750 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.19 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.02 
 
 		 235 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  32.59 
 
 		 732 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  31.02 
 
 		 721 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  37.32 
 
 		 225 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.32 
 
 		 257 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  29.58 
 
 		 726 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.07 
 
 		 746 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.58 
 
 		 726 aa  133  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.44 
 
 		 745 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.6 
 
 		 730 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.52 
 
 		 743 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  28.53 
 
 		 747 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  32.7 
 
 		 740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.15 
 
 		 242 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>