More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2887 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
438 aa  841    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  58.26 
 
 
525 aa  418  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  43.05 
 
 
503 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  42.76 
 
 
484 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  44.85 
 
 
463 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  41.28 
 
 
474 aa  282  8.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  37.56 
 
 
466 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  37.56 
 
 
505 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.13 
 
 
454 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.34 
 
 
667 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  38.78 
 
 
496 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  39.39 
 
 
477 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  36.61 
 
 
508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  38.07 
 
 
490 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  37.21 
 
 
509 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  40.73 
 
 
492 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  37.16 
 
 
615 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  38.72 
 
 
497 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.84 
 
 
529 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  35.42 
 
 
521 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  35.68 
 
 
472 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.09 
 
 
492 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  39.22 
 
 
443 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  35.66 
 
 
473 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.41 
 
 
524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.42 
 
 
453 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.38 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  30.38 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.63 
 
 
730 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.91 
 
 
482 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.78 
 
 
804 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  35.89 
 
 
790 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  32.17 
 
 
721 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  35.31 
 
 
743 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  31.13 
 
 
722 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.92 
 
 
575 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  34.8 
 
 
756 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  29.69 
 
 
539 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 
480 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  31.32 
 
 
786 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.05 
 
 
235 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.97 
 
 
730 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.58 
 
 
240 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  36.18 
 
 
232 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.57 
 
 
815 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.85 
 
 
739 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  30.5 
 
 
779 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  29.05 
 
 
732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.98 
 
 
225 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.75 
 
 
740 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  35.86 
 
 
246 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  30 
 
 
727 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  34.66 
 
 
790 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  28.89 
 
 
469 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.1 
 
 
736 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  26.44 
 
 
742 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.35 
 
 
741 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  31.75 
 
 
750 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.35 
 
 
624 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.05 
 
 
741 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.05 
 
 
741 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  28.7 
 
 
755 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.63 
 
 
217 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  34.63 
 
 
217 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  30.58 
 
 
734 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  36.54 
 
 
252 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  31.03 
 
 
527 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.92 
 
 
739 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.92 
 
 
739 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  27.42 
 
 
726 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  33.5 
 
 
225 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.92 
 
 
739 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.98 
 
 
233 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  28.21 
 
 
772 aa  123  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  34.48 
 
 
225 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  34.48 
 
 
233 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.08 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.52 
 
 
741 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
733 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  33 
 
 
225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  34.48 
 
 
233 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.91 
 
 
228 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.91 
 
 
228 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.83 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  30.63 
 
 
764 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  30.79 
 
 
770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  31.42 
 
 
257 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.83 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  34.36 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.83 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  33.5 
 
 
233 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.99 
 
 
233 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  37.95 
 
 
802 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  31.54 
 
 
763 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
234 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  31.8 
 
 
783 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  33.57 
 
 
727 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  33.5 
 
 
225 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  36.59 
 
 
257 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 
720 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>