More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0726 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  54.82 
 
 
767 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  57.24 
 
 
775 aa  886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
783 aa  1585    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  38.54 
 
 
772 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  38.46 
 
 
794 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  39.56 
 
 
795 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  34.46 
 
 
798 aa  465  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  35.79 
 
 
759 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  33.24 
 
 
796 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  33.24 
 
 
784 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.62 
 
 
786 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  30.61 
 
 
753 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  31.05 
 
 
822 aa  350  6e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.34 
 
 
815 aa  300  9e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 
815 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.94 
 
 
800 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  26.72 
 
 
802 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  26.97 
 
 
800 aa  244  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.22 
 
 
790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 
804 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.34 
 
 
806 aa  211  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.97 
 
 
730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.19 
 
 
767 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.2 
 
 
345 aa  190  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  24.63 
 
 
723 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.2 
 
 
726 aa  170  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  27.47 
 
 
820 aa  167  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 
753 aa  167  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.51 
 
 
743 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  24.22 
 
 
724 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.56 
 
 
720 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.67 
 
 
730 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  22.72 
 
 
723 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.6 
 
 
753 aa  157  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  24.53 
 
 
716 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
727 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 
736 aa  155  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.18 
 
 
744 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.08 
 
 
454 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.79 
 
 
496 aa  154  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.63 
 
 
746 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.93 
 
 
741 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.36 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.36 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.36 
 
 
726 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  23.15 
 
 
719 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.45 
 
 
803 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.18 
 
 
747 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.3 
 
 
755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  23.24 
 
 
747 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.45 
 
 
720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.99 
 
 
719 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.97 
 
 
740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  30.64 
 
 
740 aa  148  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  25.45 
 
 
744 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  34.27 
 
 
503 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  33.96 
 
 
733 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.46 
 
 
748 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.16 
 
 
726 aa  147  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
732 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  25.83 
 
 
740 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  24.82 
 
 
759 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.93 
 
 
721 aa  146  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.54 
 
 
746 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.54 
 
 
734 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.77 
 
 
730 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
740 aa  145  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.67 
 
 
745 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23 
 
 
740 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.81 
 
 
720 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  36.82 
 
 
484 aa  144  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  23.99 
 
 
753 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 
735 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.81 
 
 
720 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.37 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.32 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.91 
 
 
720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.36 
 
 
736 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.68 
 
 
720 aa  141  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.91 
 
 
720 aa  141  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.81 
 
 
235 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.52 
 
 
736 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.68 
 
 
736 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  23.21 
 
 
747 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.78 
 
 
720 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  22.87 
 
 
814 aa  140  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  21.91 
 
 
747 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.16 
 
 
741 aa  139  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.08 
 
 
739 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.07 
 
 
464 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  36.82 
 
 
472 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.13 
 
 
734 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.76 
 
 
739 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  35.21 
 
 
505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.02 
 
 
615 aa  138  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>