More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1662 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  49.54 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  50 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  49.54 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  49.07 
 
 
233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  50.7 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  48.46 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  49.54 
 
 
233 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  50.23 
 
 
225 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  49.3 
 
 
225 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  49.07 
 
 
234 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  50.23 
 
 
225 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  49.77 
 
 
225 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  45.54 
 
 
464 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  49.01 
 
 
232 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  44.6 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.22 
 
 
575 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  49.55 
 
 
224 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  50 
 
 
233 aa  191  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  50.24 
 
 
211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  42.33 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  42.47 
 
 
217 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  48.26 
 
 
235 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.5 
 
 
228 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.5 
 
 
228 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.01 
 
 
217 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  46.98 
 
 
215 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  43.15 
 
 
667 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  51.04 
 
 
492 aa  181  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.78 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  46.7 
 
 
615 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.98 
 
 
242 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  38.56 
 
 
730 aa  175  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  45.15 
 
 
524 aa  174  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.61 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  46.27 
 
 
804 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.61 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  42.67 
 
 
472 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  46.02 
 
 
463 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  43.28 
 
 
790 aa  168  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  43.84 
 
 
239 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  41.89 
 
 
746 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  40.69 
 
 
745 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  43.17 
 
 
454 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  43.56 
 
 
497 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  44.06 
 
 
508 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  43.56 
 
 
443 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  39.61 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  37.44 
 
 
734 aa  164  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  47.14 
 
 
754 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  41.98 
 
 
753 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  42.01 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  46.5 
 
 
490 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  40.27 
 
 
736 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  44.7 
 
 
529 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  42.52 
 
 
496 aa  161  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  38.31 
 
 
205 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  41.44 
 
 
747 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  42.29 
 
 
474 aa  161  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  44.22 
 
 
466 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  40.83 
 
 
503 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  42 
 
 
505 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  40.87 
 
 
766 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  39.44 
 
 
741 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  38.28 
 
 
249 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  36.95 
 
 
217 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  37.82 
 
 
727 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  43.26 
 
 
778 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  45.07 
 
 
521 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  36.52 
 
 
745 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  39.53 
 
 
722 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  40.18 
 
 
747 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  39.46 
 
 
743 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  43.81 
 
 
492 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  42.44 
 
 
605 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  36.89 
 
 
720 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  36.89 
 
 
720 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  46.11 
 
 
484 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  36.89 
 
 
720 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  42.93 
 
 
624 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  40.39 
 
 
509 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  36.73 
 
 
735 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  37.33 
 
 
720 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  38.12 
 
 
749 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  36.89 
 
 
720 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  36.44 
 
 
719 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  36.89 
 
 
720 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  36.44 
 
 
719 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  36.44 
 
 
719 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  45.19 
 
 
492 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  36.89 
 
 
720 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  36.44 
 
 
719 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  36.89 
 
 
720 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  41.58 
 
 
585 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  38.61 
 
 
721 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  37.67 
 
 
781 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  38.53 
 
 
739 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  37.02 
 
 
763 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  38.89 
 
 
795 aa  148  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  38.53 
 
 
739 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>