More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3000 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  55.79 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  48.64 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  49.53 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  49.53 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  48.6 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  48.13 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  50.25 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  48.13 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.66 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  51.53 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  49.32 
 
 		 464 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  46.26 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  44.86 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  43.86 
 
 		 722 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  46.26 
 
 		 217 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  44.39 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.79 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  47.17 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  44.39 
 
 		 225 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  44.98 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  43.46 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.99 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  46.23 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  41.67 
 
 		 736 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  48.54 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  42.01 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  43.67 
 
 		 472 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.37 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.37 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  41.83 
 
 		 734 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  44.78 
 
 		 790 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  44.04 
 
 		 463 aa  181  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  43.96 
 
 		 753 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  44.12 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.78 
 
 		 575 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  40.85 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  43.9 
 
 		 492 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  43.5 
 
 		 585 aa  175  7e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.93 
 
 		 454 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  42.79 
 
 		 524 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  38.81 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  38.36 
 
 		 615 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  37.83 
 
 		 742 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  40.83 
 
 		 730 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  41 
 
 		 509 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  38.72 
 
 		 741 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  42.57 
 
 		 508 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  38.46 
 
 		 667 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  42.08 
 
 		 505 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  41.2 
 
 		 605 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  40.51 
 
 		 804 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 492 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  39.45 
 
 		 496 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  40.76 
 
 		 624 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.3 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  40.59 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  41.51 
 
 		 529 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  42 
 
 		 497 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  39.83 
 
 		 503 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  42 
 
 		 443 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  38.43 
 
 		 745 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  44.93 
 
 		 484 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.91 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  39.63 
 
 		 521 aa  159  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  46.11 
 
 		 803 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  37.8 
 
 		 474 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  38.74 
 
 		 795 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  42.29 
 
 		 803 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 		 746 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  37.02 
 
 		 766 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.15 
 
 		 482 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  39.47 
 
 		 205 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36.21 
 
 		 779 aa  150  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  39.41 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  40.28 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  35.39 
 
 		 745 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  37.14 
 
 		 763 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  37.91 
 
 		 492 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.62 
 
 		 453 aa  148  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  39.22 
 
 		 772 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  35.75 
 
 		 721 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  36.82 
 
 		 727 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 		 747 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  38.38 
 
 		 750 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.21 
 
 		 720 aa  145  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  35.44 
 
 		 739 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  37.8 
 
 		 790 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  40.3 
 
 		 525 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  41.67 
 
 		 490 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  33.93 
 
 		 730 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  34.09 
 
 		 720 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  35.38 
 
 		 735 aa  142  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  42.42 
 
 		 774 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  35.12 
 
 		 802 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  32.73 
 
 		 719 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  32.73 
 
 		 719 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  35.89 
 
 		 786 aa  138  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>