More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4042 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  93.3 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  71.08 
 
 		 211 aa  280  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  56.81 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  51.92 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  50 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  48.8 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  48.8 
 
 		 575 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  43.19 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  47.42 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  42.72 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  42.72 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  42.99 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  46.48 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  42.25 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  42.25 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  42.25 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.99 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.64 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  42.72 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  42.72 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  41.78 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.01 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.31 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  49.3 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.12 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  46.01 
 
 		 472 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  43.26 
 
 		 464 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  46.27 
 
 		 804 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  46.88 
 
 		 615 aa  181  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  44.61 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  44.86 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  46.31 
 
 		 492 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  42.8 
 
 		 667 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  44.33 
 
 		 790 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  45.32 
 
 		 496 aa  174  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  40.19 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  45.21 
 
 		 463 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  41.59 
 
 		 734 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  44.66 
 
 		 753 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  47.8 
 
 		 605 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.64 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.64 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  40.78 
 
 		 585 aa  164  8e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  37.19 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  44.74 
 
 		 490 aa  161  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  41.71 
 
 		 497 aa  161  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  41.5 
 
 		 508 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  41.71 
 
 		 443 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  46.31 
 
 		 624 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.74 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  38.68 
 
 		 730 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  39.6 
 
 		 509 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  37.09 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.76 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  40.5 
 
 		 505 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  41.28 
 
 		 503 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  42.99 
 
 		 524 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  39.11 
 
 		 474 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  42.92 
 
 		 529 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  40.8 
 
 		 466 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  38.97 
 
 		 722 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  43.14 
 
 		 521 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  41.47 
 
 		 741 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  43.13 
 
 		 525 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  39.6 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  41.2 
 
 		 743 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  39.57 
 
 		 790 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  40.64 
 
 		 766 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  39.7 
 
 		 772 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  38.18 
 
 		 795 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  39.6 
 
 		 806 aa  144  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  38.86 
 
 		 803 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  41.36 
 
 		 492 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  41.09 
 
 		 484 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  35.62 
 
 		 736 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  40.09 
 
 		 778 aa  141  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  37.81 
 
 		 727 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  35.02 
 
 		 745 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  38.07 
 
 		 774 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  37.24 
 
 		 721 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  41.92 
 
 		 492 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  35.47 
 
 		 735 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  34.38 
 
 		 720 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  34.82 
 
 		 720 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  33.94 
 
 		 720 aa  136  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  36.71 
 
 		 745 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  41.99 
 
 		 473 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  34.38 
 
 		 720 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  37.93 
 
 		 802 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  34.38 
 
 		 720 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  35.11 
 
 		 763 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.65 
 
 		 726 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  34.65 
 
 		 726 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  37.13 
 
 		 803 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>