More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0541 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
217 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.48 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  43 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.12 
 
 
235 aa  171  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.21 
 
 
472 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  40.37 
 
 
464 aa  157  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  37.38 
 
 
454 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  38.35 
 
 
225 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.89 
 
 
463 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  37.62 
 
 
225 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  37.93 
 
 
529 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  40.74 
 
 
492 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  38.69 
 
 
505 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  41.67 
 
 
246 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  34.88 
 
 
521 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  34.62 
 
 
615 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  37.86 
 
 
257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  37.38 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  38.97 
 
 
474 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  39.71 
 
 
221 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  39.15 
 
 
492 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.31 
 
 
232 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.95 
 
 
240 aa  147  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.41 
 
 
482 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  38.12 
 
 
774 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.9 
 
 
508 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  36.68 
 
 
239 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.61 
 
 
215 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.92 
 
 
225 aa  144  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  40.59 
 
 
233 aa  144  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  35.47 
 
 
233 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  39.6 
 
 
224 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.78 
 
 
524 aa  143  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  36.92 
 
 
466 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 
453 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  34.48 
 
 
233 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  34.48 
 
 
233 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  34.87 
 
 
497 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  35.92 
 
 
225 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  34.45 
 
 
667 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  35.58 
 
 
490 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.34 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.48 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  34.87 
 
 
443 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.87 
 
 
496 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  33.99 
 
 
233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  35.38 
 
 
509 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  37.11 
 
 
803 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  36.18 
 
 
525 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  39.22 
 
 
249 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  36.54 
 
 
755 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.27 
 
 
230 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.27 
 
 
230 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  36.92 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.58 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.58 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  37.69 
 
 
252 aa  135  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  37 
 
 
726 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.02 
 
 
745 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.33 
 
 
575 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  36.6 
 
 
803 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  32.31 
 
 
802 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  34.5 
 
 
727 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  36.92 
 
 
484 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  37 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.51 
 
 
804 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  37.17 
 
 
257 aa  132  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  35.47 
 
 
798 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.67 
 
 
730 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  37.13 
 
 
731 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  32.83 
 
 
740 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  35.92 
 
 
721 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.98 
 
 
732 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.74 
 
 
242 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.41 
 
 
503 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  37.31 
 
 
753 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  35.64 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  33.5 
 
 
741 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
741 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  37.57 
 
 
205 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.5 
 
 
741 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  34.62 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  33.17 
 
 
739 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  33.17 
 
 
739 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  33 
 
 
741 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.17 
 
 
739 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  32.12 
 
 
746 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 
741 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  33.5 
 
 
741 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 
766 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  32.47 
 
 
723 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  31.6 
 
 
739 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33 
 
 
741 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  37.57 
 
 
790 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.02 
 
 
739 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  32.8 
 
 
745 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  31.75 
 
 
724 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 
738 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  33.99 
 
 
734 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>