More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0081 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 766 aa  1538    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.96 
 
 		 779 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.71 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  28.67 
 
 		 753 aa  238  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.34 
 
 		 745 aa  230  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  26.96 
 
 		 737 aa  229  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.99 
 
 		 721 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 		 756 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.51 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.52 
 
 		 790 aa  211  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.81 
 
 		 736 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.59 
 
 		 797 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.02 
 
 		 720 aa  200  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.99 
 
 		 464 aa  200  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.44 
 
 		 770 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.71 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.35 
 
 		 711 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.19 
 
 		 739 aa  197  9e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 737 aa  194  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.88 
 
 		 774 aa  193  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.22 
 
 		 722 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.39 
 
 		 727 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  40.78 
 
 		 496 aa  189  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.9 
 
 		 739 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.9 
 
 		 739 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.9 
 
 		 739 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  31.47 
 
 		 527 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.37 
 
 		 755 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.51 
 
 		 741 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.45 
 
 		 733 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.5 
 
 		 732 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.42 
 
 		 741 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.43 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.94 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.43 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.91 
 
 		 756 aa  173  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.43 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  25.69 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.36 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.14 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.62 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 738 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.14 
 
 		 741 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  37.1 
 
 		 508 aa  171  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.1 
 
 		 756 aa  171  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.84 
 
 		 740 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.21 
 
 		 806 aa  170  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.56 
 
 		 505 aa  170  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.48 
 
 		 575 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  28.6 
 
 		 790 aa  167  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  37.55 
 
 		 466 aa  167  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.58 
 
 		 667 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27 
 
 		 730 aa  165  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.04 
 
 		 722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.67 
 
 		 454 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.07 
 
 		 463 aa  163  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.03 
 
 		 802 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.39 
 
 		 738 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.55 
 
 		 723 aa  160  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.13 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.72 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.52 
 
 		 815 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  28.13 
 
 		 746 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.79 
 
 		 240 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  25.6 
 
 		 723 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 		 734 aa  154  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  30.32 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  27.57 
 
 		 795 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.84 
 
 		 217 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  34.84 
 
 		 217 aa  150  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  35.59 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.67 
 
 		 719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  28.67 
 
 		 719 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  33.23 
 
 		 521 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  28.67 
 
 		 719 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  28.67 
 
 		 719 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  26.41 
 
 		 740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  28.67 
 
 		 719 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  27.19 
 
 		 815 aa  147  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.39 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  35.86 
 
 		 443 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.86 
 
 		 872 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  35.86 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.72 
 
 		 492 aa  145  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  28.66 
 
 		 624 aa  145  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  27.43 
 
 		 720 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  27.43 
 
 		 720 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  27.43 
 
 		 720 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  27.43 
 
 		 720 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  27.43 
 
 		 720 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 		 731 aa  144  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  22.75 
 
 		 798 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  33.55 
 
 		 529 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  27.43 
 
 		 720 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  27.43 
 
 		 720 aa  144  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.49 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  32.97 
 
 		 747 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>