More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3274 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  62.33 
 
 
233 aa  294  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  62.33 
 
 
233 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  61.88 
 
 
233 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  62.33 
 
 
233 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  61.88 
 
 
233 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  60.99 
 
 
234 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  56.14 
 
 
225 aa  268  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  55.7 
 
 
225 aa  268  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  55.26 
 
 
225 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  54.82 
 
 
257 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  54.82 
 
 
225 aa  259  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  54.39 
 
 
225 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  52.74 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  47.62 
 
 
464 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  49.3 
 
 
217 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  51.69 
 
 
235 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  47.91 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  49.08 
 
 
224 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  50.47 
 
 
252 aa  208  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  48.15 
 
 
233 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  50.25 
 
 
242 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.69 
 
 
230 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  49.01 
 
 
240 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  47.69 
 
 
230 aa  204  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  46.33 
 
 
575 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  46.12 
 
 
220 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  42.13 
 
 
221 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  45.1 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.13 
 
 
228 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.13 
 
 
228 aa  187  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  43.91 
 
 
239 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  43.52 
 
 
722 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  44.6 
 
 
454 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  45.41 
 
 
492 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  39.73 
 
 
790 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 
753 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  43.9 
 
 
211 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  40.35 
 
 
496 aa  177  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  44.28 
 
 
472 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  43 
 
 
585 aa  176  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  38.05 
 
 
730 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  41.98 
 
 
505 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  38.81 
 
 
734 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  40.48 
 
 
509 aa  171  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  40.67 
 
 
763 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  43.58 
 
 
463 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  41.55 
 
 
804 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  44.06 
 
 
474 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  45.63 
 
 
615 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  41.67 
 
 
605 aa  168  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  45.81 
 
 
484 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  40.99 
 
 
667 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  41.75 
 
 
205 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  40.09 
 
 
736 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  40.27 
 
 
249 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.65 
 
 
215 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  41.18 
 
 
624 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  41.18 
 
 
727 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  41.51 
 
 
497 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  41.51 
 
 
443 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  39.91 
 
 
786 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  38.4 
 
 
790 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  42.58 
 
 
525 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  41.74 
 
 
503 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  38.89 
 
 
741 aa  158  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  45.26 
 
 
492 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  45.03 
 
 
246 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  40.7 
 
 
466 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  41.75 
 
 
524 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  43.41 
 
 
229 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  39.41 
 
 
739 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  40.39 
 
 
217 aa  154  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  40.51 
 
 
742 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  43.33 
 
 
801 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  42.93 
 
 
521 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  43.01 
 
 
774 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  37.55 
 
 
747 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  38.16 
 
 
508 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  43.68 
 
 
490 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  35.14 
 
 
745 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  41.51 
 
 
529 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  34.38 
 
 
730 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  41.06 
 
 
721 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  40.61 
 
 
713 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  37.5 
 
 
756 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 
747 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.27 
 
 
453 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  36.22 
 
 
735 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 
779 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  36.62 
 
 
806 aa  148  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  38.81 
 
 
279 aa  148  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  35.14 
 
 
746 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.63 
 
 
741 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  39.63 
 
 
741 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  39.63 
 
 
741 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  39.53 
 
 
802 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  33.63 
 
 
766 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  41.15 
 
 
772 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.17 
 
 
741 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>