More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12770 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12770  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  43.42 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  43.84 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  40.2 
 
 		 472 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  38.84 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  37 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  36.56 
 
 		 233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  39.29 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  36.12 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  35.68 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.76 
 
 		 234 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.93 
 
 		 225 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  35.06 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  34.2 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.2 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  36.87 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  35.06 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.87 
 
 		 217 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.77 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.98 
 
 		 667 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  37.38 
 
 		 734 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.55 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.01 
 
 		 230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.01 
 
 		 230 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  37 
 
 		 463 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  37.8 
 
 		 615 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  36.65 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  35.07 
 
 		 464 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.96 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.96 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  35.82 
 
 		 742 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  36.73 
 
 		 211 aa  125  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.6 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.57 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  37.56 
 
 		 224 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  37.21 
 
 		 721 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  36.59 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  34.3 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  37.23 
 
 		 509 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  35.29 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.65 
 
 		 454 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  35.2 
 
 		 508 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  33.96 
 
 		 741 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  38.46 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.67 
 
 		 505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.2 
 
 		 730 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  35.61 
 
 		 766 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  29.39 
 
 		 763 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  35.42 
 
 		 496 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.6 
 
 		 736 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  35.07 
 
 		 743 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  33.79 
 
 		 529 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  33.03 
 
 		 497 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.85 
 
 		 745 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.61 
 
 		 575 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33 
 
 		 605 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  31.4 
 
 		 756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  33.87 
 
 		 802 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 521 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  34.05 
 
 		 492 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 		 490 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  32.12 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.65 
 
 		 720 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  30.88 
 
 		 739 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  30.65 
 
 		 755 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  32.99 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  34.48 
 
 		 779 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  35.2 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.48 
 
 		 756 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.17 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  35.53 
 
 		 492 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  31.25 
 
 		 727 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.87 
 
 		 753 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.84 
 
 		 739 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  31.68 
 
 		 624 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.03 
 
 		 741 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.84 
 
 		 739 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.96 
 
 		 739 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  33.02 
 
 		 803 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.6 
 
 		 741 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.84 
 
 		 739 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.53 
 
 		 738 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  30.22 
 
 		 751 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.35 
 
 		 741 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.52 
 
 		 722 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  33.65 
 
 		 801 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  34.81 
 
 		 741 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.93 
 
 		 482 aa  106  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  29.67 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.28 
 
 		 804 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.24 
 
 		 749 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  30.53 
 
 		 803 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.86 
 
 		 741 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  33.17 
 
 		 734 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  31.86 
 
 		 741 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.75 
 
 		 726 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  31.86 
 
 		 741 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>