More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1657 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
721 aa  1478    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  38.94 
 
 
730 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.45 
 
 
753 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.04 
 
 
745 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  30.35 
 
 
772 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.31 
 
 
737 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.25 
 
 
779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.13 
 
 
743 aa  280  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  28.38 
 
 
756 aa  278  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
737 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
738 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 
804 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.15 
 
 
790 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27.03 
 
 
755 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  28.11 
 
 
727 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.39 
 
 
731 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 
756 aa  248  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.74 
 
 
774 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.65 
 
 
726 aa  239  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 
797 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 
756 aa  231  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.96 
 
 
739 aa  228  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.45 
 
 
711 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.26 
 
 
722 aa  227  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  35.42 
 
 
464 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.03 
 
 
770 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.2 
 
 
720 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 
734 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  26.73 
 
 
872 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29 
 
 
527 aa  207  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.25 
 
 
750 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.06 
 
 
806 aa  206  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.27 
 
 
738 aa  204  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.2 
 
 
734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  29.39 
 
 
766 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.99 
 
 
733 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.2 
 
 
722 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 
710 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.85 
 
 
747 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.94 
 
 
720 aa  191  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 
742 aa  190  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.52 
 
 
454 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
741 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.67 
 
 
667 aa  187  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.91 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.8 
 
 
739 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.1 
 
 
736 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  33.24 
 
 
764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.18 
 
 
741 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  33.24 
 
 
505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25 
 
 
741 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  24.67 
 
 
803 aa  183  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.91 
 
 
739 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.91 
 
 
739 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  34.2 
 
 
755 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.91 
 
 
739 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  32.62 
 
 
747 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.74 
 
 
492 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.82 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.18 
 
 
741 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.18 
 
 
741 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.18 
 
 
741 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  31.67 
 
 
746 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.96 
 
 
741 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.19 
 
 
496 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.24 
 
 
746 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
745 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.59 
 
 
802 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.21 
 
 
724 aa  174  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.81 
 
 
575 aa  173  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  30.27 
 
 
719 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.68 
 
 
508 aa  173  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  30.1 
 
 
720 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  30.1 
 
 
720 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.71 
 
 
745 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  22.62 
 
 
753 aa  173  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  30.1 
 
 
720 aa  172  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  30.02 
 
 
719 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  30.1 
 
 
720 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  30.1 
 
 
720 aa  172  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.48 
 
 
750 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  30.1 
 
 
720 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  30.1 
 
 
720 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  30.02 
 
 
719 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27 
 
 
747 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  30.02 
 
 
719 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.85 
 
 
720 aa  172  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  30.02 
 
 
719 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.2 
 
 
732 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  36.79 
 
 
615 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.06 
 
 
748 aa  170  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.6 
 
 
726 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.6 
 
 
726 aa  170  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.56 
 
 
740 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.6 
 
 
726 aa  170  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.62 
 
 
758 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.84 
 
 
782 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.34 
 
 
723 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.6 
 
 
726 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  29.6 
 
 
726 aa  170  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>