More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2106 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 
724 aa  1454    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  27.54 
 
 
735 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 
737 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.89 
 
 
745 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
721 aa  188  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
730 aa  185  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 
738 aa  183  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
737 aa  171  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.23 
 
 
739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.63 
 
 
753 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.03 
 
 
755 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 
727 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.12 
 
 
743 aa  161  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 
779 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.3 
 
 
736 aa  157  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 
804 aa  157  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.75 
 
 
464 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.3 
 
 
756 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.24 
 
 
758 aa  152  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.2 
 
 
756 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.64 
 
 
527 aa  150  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.54 
 
 
734 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.06 
 
 
774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.08 
 
 
738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.59 
 
 
772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.04 
 
 
772 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.67 
 
 
727 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.86 
 
 
770 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.82 
 
 
463 aa  146  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.71 
 
 
734 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.45 
 
 
731 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.22 
 
 
790 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.29 
 
 
739 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.76 
 
 
454 aa  144  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.45 
 
 
758 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.83 
 
 
575 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  25.12 
 
 
750 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 
711 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.17 
 
 
720 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.58 
 
 
726 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.79 
 
 
492 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
745 aa  140  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.78 
 
 
733 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  25.29 
 
 
763 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  36.41 
 
 
233 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.19 
 
 
235 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.27 
 
 
756 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.41 
 
 
234 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  34.51 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  27.54 
 
 
741 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  35.92 
 
 
233 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  35.92 
 
 
233 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  35.92 
 
 
233 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.67 
 
 
756 aa  134  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.26 
 
 
722 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  35.92 
 
 
233 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 
753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  26.78 
 
 
746 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 
797 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.59 
 
 
521 aa  131  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  23.21 
 
 
802 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  36.1 
 
 
232 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  34.15 
 
 
221 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.09 
 
 
503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33.68 
 
 
484 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  33.67 
 
 
529 aa  127  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  35.2 
 
 
477 aa  127  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  29.74 
 
 
747 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.47 
 
 
508 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  23.18 
 
 
708 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  32.65 
 
 
778 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.46 
 
 
776 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  38.54 
 
 
224 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.58 
 
 
806 aa  125  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  31.21 
 
 
748 aa  125  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.62 
 
 
505 aa  125  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.31 
 
 
667 aa  124  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  29.52 
 
 
466 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.19 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.87 
 
 
782 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.97 
 
 
240 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
759 aa  121  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  37.44 
 
 
233 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.84 
 
 
788 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  29.53 
 
 
710 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.87 
 
 
720 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  31.38 
 
 
757 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  27.55 
 
 
741 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  36.62 
 
 
525 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.65 
 
 
750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  27.25 
 
 
744 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  28.46 
 
 
740 aa  119  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  27.27 
 
 
741 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  27.85 
 
 
734 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  31.35 
 
 
755 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  28.52 
 
 
496 aa  117  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  27.55 
 
 
472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  33 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.74 
 
 
744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.31 
 
 
736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>