More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3874 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 778 aa  1585    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  29.46 
 
 		 741 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  38.16 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  33.75 
 
 		 741 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.75 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.49 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  33.25 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.75 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  32.75 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  32.75 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.93 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  40 
 
 		 257 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.07 
 
 		 756 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.79 
 
 		 240 aa  150  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  39.52 
 
 		 225 aa  149  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.57 
 
 		 225 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.66 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  39.05 
 
 		 225 aa  149  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  40 
 
 		 225 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  33.45 
 
 		 759 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  39.52 
 
 		 225 aa  147  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.52 
 
 		 804 aa  145  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 		 722 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.03 
 
 		 464 aa  144  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 737 aa  144  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.49 
 
 		 454 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.34 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  36.4 
 
 		 490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.34 
 
 		 739 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.07 
 
 		 739 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  27.66 
 
 		 724 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  38.81 
 
 		 246 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.17 
 
 		 740 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  37.33 
 
 		 233 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.52 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  38.25 
 
 		 233 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  41.86 
 
 		 746 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  28.57 
 
 		 723 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  39.42 
 
 		 232 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  37.79 
 
 		 233 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.09 
 
 		 743 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.05 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.33 
 
 		 234 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  28.36 
 
 		 719 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  28.36 
 
 		 719 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  28.36 
 
 		 719 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  38.25 
 
 		 233 aa  137  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  37.79 
 
 		 233 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.95 
 
 		 720 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.08 
 
 		 732 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  28.71 
 
 		 719 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.79 
 
 		 790 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.95 
 
 		 720 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  29.2 
 
 		 720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  28.12 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  32.03 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.95 
 
 		 720 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.95 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.95 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  33.22 
 
 		 747 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  36.55 
 
 		 220 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.95 
 
 		 720 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  28.68 
 
 		 724 aa  135  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.95 
 
 		 720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  38.07 
 
 		 735 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  29.12 
 
 		 722 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  29.6 
 
 		 780 aa  134  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  36.09 
 
 		 509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 		 217 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  36.19 
 
 		 217 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.24 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.4 
 
 		 730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  27.35 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.98 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  34.67 
 
 		 751 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  35.69 
 
 		 624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  37.9 
 
 		 453 aa  131  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  36.24 
 
 		 753 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.68 
 
 		 736 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  40.89 
 
 		 790 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  39.63 
 
 		 239 aa  130  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.75 
 
 		 742 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  27.3 
 
 		 727 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  40.69 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.03 
 
 		 508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  27.76 
 
 		 716 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.69 
 
 		 667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  36.25 
 
 		 605 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  40.57 
 
 		 233 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  36.36 
 
 		 252 aa  128  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  36.84 
 
 		 803 aa  127  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  32.7 
 
 		 221 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  36.82 
 
 		 747 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  28.02 
 
 		 723 aa  127  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  29.28 
 
 		 740 aa  127  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  38.5 
 
 		 754 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  37.38 
 
 		 803 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  36.54 
 
 		 745 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.76 
 
 		 726 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  31.49 
 
 		 766 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>