More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3224 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
733 aa  1483    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  32.44 
 
 
737 aa  321  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  31.25 
 
 
727 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  28.41 
 
 
753 aa  282  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  29.81 
 
 
797 aa  271  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.2 
 
 
743 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.32 
 
 
779 aa  246  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
737 aa  235  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 
756 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 
738 aa  231  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.39 
 
 
756 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.21 
 
 
772 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.78 
 
 
745 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  26.08 
 
 
788 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.63 
 
 
755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.99 
 
 
721 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 
804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.21 
 
 
756 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.4 
 
 
711 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.17 
 
 
790 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.9 
 
 
774 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.8 
 
 
726 aa  191  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 
731 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.84 
 
 
720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 
734 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 
738 aa  185  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28.47 
 
 
710 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.85 
 
 
527 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.65 
 
 
720 aa  178  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 
731 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  28.09 
 
 
736 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.03 
 
 
776 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  36.31 
 
 
492 aa  171  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 
789 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.43 
 
 
750 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.79 
 
 
741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.66 
 
 
742 aa  167  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.94 
 
 
753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.98 
 
 
464 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.25 
 
 
734 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.66 
 
 
772 aa  164  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 
745 aa  164  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.63 
 
 
790 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 
770 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.9 
 
 
778 aa  161  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.46 
 
 
496 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.38 
 
 
710 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.97 
 
 
756 aa  159  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.19 
 
 
747 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.73 
 
 
872 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  32.53 
 
 
733 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  25 
 
 
466 aa  157  9e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.59 
 
 
739 aa  157  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
467 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.64 
 
 
806 aa  157  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.64 
 
 
739 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.05 
 
 
750 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 
741 aa  156  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.88 
 
 
766 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.1 
 
 
730 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.61 
 
 
758 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30 
 
 
739 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30 
 
 
739 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30 
 
 
739 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.75 
 
 
741 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.61 
 
 
708 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  35.71 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  38.38 
 
 
463 aa  149  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.4 
 
 
758 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.18 
 
 
771 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  29.98 
 
 
745 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.18 
 
 
789 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.68 
 
 
722 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.04 
 
 
727 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.75 
 
 
746 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  27.05 
 
 
740 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.18 
 
 
741 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  29.21 
 
 
746 aa  145  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.22 
 
 
734 aa  145  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.1 
 
 
741 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  25.07 
 
 
736 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  25.51 
 
 
472 aa  144  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  28.24 
 
 
778 aa  144  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  34.9 
 
 
477 aa  143  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  27.23 
 
 
732 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.61 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.42 
 
 
763 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.55 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  27.75 
 
 
727 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  23.39 
 
 
753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.92 
 
 
454 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.06 
 
 
741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.14 
 
 
741 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.57 
 
 
667 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.14 
 
 
741 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.14 
 
 
741 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  32.13 
 
 
624 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.26 
 
 
747 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>