More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4846 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
742 aa  1482    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  39.89 
 
 
734 aa  548  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  40.81 
 
 
722 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  39.22 
 
 
736 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  38.92 
 
 
741 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  29.71 
 
 
727 aa  290  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  27.6 
 
 
750 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.63 
 
 
720 aa  239  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  27.62 
 
 
753 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  25.83 
 
 
763 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.98 
 
 
739 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 
804 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.61 
 
 
790 aa  205  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 
778 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 
756 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 
730 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  25.58 
 
 
741 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 
721 aa  185  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  25.68 
 
 
684 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 
711 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  30.34 
 
 
722 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  25.94 
 
 
801 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.51 
 
 
806 aa  177  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  30.07 
 
 
724 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  25.38 
 
 
743 aa  174  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.08 
 
 
726 aa  172  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 
755 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.17 
 
 
743 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.54 
 
 
727 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 
760 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.95 
 
 
726 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.74 
 
 
756 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.24 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.48 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.95 
 
 
739 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  35.71 
 
 
509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.09 
 
 
739 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  24.39 
 
 
719 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  25.1 
 
 
720 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  29.38 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.98 
 
 
739 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  25.1 
 
 
720 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  24.56 
 
 
719 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 
753 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.81 
 
 
739 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.59 
 
 
454 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  26.47 
 
 
795 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  29.38 
 
 
719 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  24.59 
 
 
716 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  24.97 
 
 
720 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  28.22 
 
 
764 aa  162  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  24.97 
 
 
720 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  29.71 
 
 
720 aa  161  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  42.56 
 
 
233 aa  161  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.86 
 
 
774 aa  161  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  29.71 
 
 
720 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.63 
 
 
790 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  29.71 
 
 
720 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  29.71 
 
 
720 aa  160  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  29.12 
 
 
719 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  42.56 
 
 
233 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  42.56 
 
 
233 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  42.56 
 
 
233 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.68 
 
 
741 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.54 
 
 
234 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  40.48 
 
 
233 aa  158  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.14 
 
 
217 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  27.14 
 
 
803 aa  158  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.86 
 
 
217 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  26.45 
 
 
795 aa  157  8e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.9 
 
 
741 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.05 
 
 
820 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 
731 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  29.18 
 
 
720 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  26.05 
 
 
741 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  22.92 
 
 
815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  28.3 
 
 
721 aa  155  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.27 
 
 
741 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  26.27 
 
 
741 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
731 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  26.27 
 
 
741 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  34.77 
 
 
490 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.11 
 
 
464 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  26.24 
 
 
803 aa  154  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.78 
 
 
748 aa  154  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 
737 aa  154  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
738 aa  153  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.56 
 
 
736 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.83 
 
 
779 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.51 
 
 
232 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25 
 
 
733 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
741 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  25.99 
 
 
786 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  27.93 
 
 
814 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>