More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1385 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1547    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  43.57 
 
 		 737 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  42.86 
 
 		 755 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 		 738 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  36.43 
 
 		 731 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  35.7 
 
 		 726 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  34.12 
 
 		 770 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  30.26 
 
 		 753 aa  317  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.28 
 
 		 779 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 730 aa  283  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.63 
 
 		 734 aa  273  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  32.14 
 
 		 527 aa  266  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.21 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 		 756 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.41 
 
 		 738 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 710 aa  259  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  29.77 
 
 		 872 aa  257  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.94 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.99 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.2 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.63 
 
 		 710 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.09 
 
 		 745 aa  236  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  26.49 
 
 		 708 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  25.52 
 
 		 772 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.73 
 
 		 743 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 		 756 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  25.75 
 
 		 797 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.1 
 
 		 727 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.64 
 
 		 739 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 745 aa  220  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.05 
 
 		 733 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.82 
 
 		 750 aa  210  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.24 
 
 		 772 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.1 
 
 		 753 aa  205  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  26.16 
 
 		 774 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  25.81 
 
 		 756 aa  201  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.73 
 
 		 776 aa  201  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.25 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  23.24 
 
 		 788 aa  190  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.13 
 
 		 789 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 		 711 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.04 
 
 		 739 aa  187  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 804 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.94 
 
 		 790 aa  182  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.02 
 
 		 734 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.62 
 
 		 720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.33 
 
 		 789 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.33 
 
 		 771 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  26.74 
 
 		 741 aa  178  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  24.43 
 
 		 790 aa  171  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  25.85 
 
 		 721 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.91 
 
 		 734 aa  171  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.34 
 
 		 806 aa  170  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.74 
 
 		 742 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 759 aa  167  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.8 
 
 		 779 aa  167  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.71 
 
 		 748 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.42 
 
 		 736 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  25.77 
 
 		 721 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 764 aa  160  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.38 
 
 		 744 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  26.2 
 
 		 744 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 		 815 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.34 
 
 		 720 aa  154  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  24.82 
 
 		 782 aa  154  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.66 
 
 		 745 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  24.87 
 
 		 747 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  24.76 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.82 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 464 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  24.76 
 
 		 719 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  27.07 
 
 		 778 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  24.76 
 
 		 719 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  23.94 
 
 		 755 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 		 722 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  24.66 
 
 		 719 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 		 718 aa  150  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  40 
 
 		 233 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  29.19 
 
 		 741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 766 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  40 
 
 		 233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.92 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  25.23 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.73 
 
 		 741 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  24.76 
 
 		 719 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  23.76 
 
 		 766 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.46 
 
 		 736 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 735 aa  148  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.72 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  26.58 
 
 		 747 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.05 
 
 		 234 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  27.43 
 
 		 720 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  39.52 
 
 		 233 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.09 
 
 		 739 aa  147  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 		 776 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  39.52 
 
 		 233 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 724 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>