More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0065 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
795 aa  1616    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  43.29 
 
 
772 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  40.94 
 
 
775 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  39.89 
 
 
783 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  37.09 
 
 
767 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  36.69 
 
 
794 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  34.69 
 
 
798 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  32.22 
 
 
759 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  32.85 
 
 
784 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  32.07 
 
 
796 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  30.5 
 
 
753 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  29.39 
 
 
822 aa  337  5.999999999999999e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.79 
 
 
786 aa  330  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  28.29 
 
 
800 aa  313  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  27.92 
 
 
815 aa  302  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  26.71 
 
 
802 aa  297  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  28.49 
 
 
790 aa  292  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  28.63 
 
 
815 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
804 aa  270  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  27.99 
 
 
800 aa  265  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.17 
 
 
806 aa  233  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.35 
 
 
345 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.37 
 
 
734 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  25.88 
 
 
720 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  25.88 
 
 
720 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  25.16 
 
 
720 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  25.75 
 
 
720 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  25.32 
 
 
720 aa  205  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  25.75 
 
 
720 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  25.88 
 
 
720 aa  204  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  25.88 
 
 
720 aa  203  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  25.06 
 
 
720 aa  203  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.04 
 
 
820 aa  201  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  24.07 
 
 
719 aa  200  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  24.07 
 
 
719 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  24.07 
 
 
719 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.36 
 
 
732 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  23.94 
 
 
719 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  24.07 
 
 
719 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 
726 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.7 
 
 
740 aa  194  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.9 
 
 
730 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.41 
 
 
746 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 
741 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.9 
 
 
741 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.44 
 
 
741 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  24.3 
 
 
744 aa  190  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 
735 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 
741 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  25 
 
 
759 aa  188  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.66 
 
 
753 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.22 
 
 
741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.22 
 
 
741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.22 
 
 
741 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.91 
 
 
739 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.73 
 
 
739 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.73 
 
 
739 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.49 
 
 
753 aa  183  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  24.25 
 
 
723 aa  183  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.73 
 
 
739 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.69 
 
 
730 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.91 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  23.19 
 
 
753 aa  181  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  23.87 
 
 
744 aa  180  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  26.83 
 
 
745 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.26 
 
 
736 aa  178  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.88 
 
 
746 aa  178  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25 
 
 
726 aa  178  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25 
 
 
726 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  25 
 
 
726 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25 
 
 
726 aa  177  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25 
 
 
726 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25 
 
 
726 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  25.42 
 
 
726 aa  177  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  25.49 
 
 
724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.91 
 
 
736 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  21.78 
 
 
767 aa  174  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.48 
 
 
750 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
737 aa  173  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.73 
 
 
741 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.42 
 
 
744 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.93 
 
 
748 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 
747 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  23.72 
 
 
749 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.39 
 
 
746 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  23.91 
 
 
747 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.73 
 
 
747 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 
753 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.55 
 
 
755 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.69 
 
 
743 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.23 
 
 
723 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.46 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  24.43 
 
 
734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.23 
 
 
756 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.43 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  24.75 
 
 
750 aa  165  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  24.21 
 
 
733 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 
722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 
727 aa  163  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>