More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1178 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  100 
 
 		 527 aa  1066    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  38.29 
 
 		 755 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  37.81 
 
 		 737 aa  356  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  36.9 
 
 		 770 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 		 738 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  32.88 
 
 		 731 aa  297  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  33.65 
 
 		 756 aa  296  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  31.79 
 
 		 726 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.31 
 
 		 730 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  31.56 
 
 		 756 aa  235  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  29 
 
 		 721 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 		 708 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.57 
 
 		 743 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.89 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  30.83 
 
 		 734 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  28.79 
 
 		 756 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  32.55 
 
 		 790 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  28.86 
 
 		 727 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  30.17 
 
 		 737 aa  211  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.26 
 
 		 733 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.14 
 
 		 745 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  30.71 
 
 		 872 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 804 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.11 
 
 		 753 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.6 
 
 		 738 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  33.85 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  28.4 
 
 		 797 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 772 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  27.99 
 
 		 734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  27.27 
 
 		 806 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.52 
 
 		 774 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  30.12 
 
 		 766 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  26.21 
 
 		 753 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.98 
 
 		 741 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.82 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.59 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.9 
 
 		 772 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.82 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.82 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 745 aa  173  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  35.15 
 
 		 741 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.47 
 
 		 750 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.52 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.52 
 
 		 741 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  29.2 
 
 		 739 aa  170  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.61 
 
 		 739 aa  170  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  28.22 
 
 		 710 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  30.4 
 
 		 734 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  28.97 
 
 		 739 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  28.97 
 
 		 739 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  28.97 
 
 		 739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.23 
 
 		 778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.85 
 
 		 739 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  31.8 
 
 		 736 aa  163  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.96 
 
 		 788 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  33.79 
 
 		 496 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  28.91 
 
 		 722 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  26.79 
 
 		 794 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  28.5 
 
 		 820 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  28.98 
 
 		 750 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  27.75 
 
 		 750 aa  160  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.22 
 
 		 741 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.95 
 
 		 732 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 		 759 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.76 
 
 		 726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  32.34 
 
 		 529 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  29.54 
 
 		 740 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  32.67 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.09 
 
 		 667 aa  156  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 		 711 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.8 
 
 		 720 aa  156  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.1 
 
 		 746 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.33 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  27.19 
 
 		 764 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.28 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  27.51 
 
 		 747 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.86 
 
 		 742 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  29.1 
 
 		 747 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  27.06 
 
 		 746 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  26.82 
 
 		 751 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.73 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.6 
 
 		 724 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  29.44 
 
 		 747 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.89 
 
 		 802 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  28.61 
 
 		 745 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.53 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.31 
 
 		 730 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 		 575 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  31.86 
 
 		 721 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.5 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  25.92 
 
 		 786 aa  150  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  30.75 
 
 		 763 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  29.07 
 
 		 746 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33 
 
 		 484 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  29.89 
 
 		 740 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.7 
 
 		 492 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.19 
 
 		 747 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  30.2 
 
 		 749 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.06 
 
 		 776 aa  147  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.93 
 
 		 235 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>