More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2999 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 
738 aa  1478    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  33 
 
 
756 aa  341  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.65 
 
 
724 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.22 
 
 
726 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
750 aa  290  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.84 
 
 
734 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  33.52 
 
 
773 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  33.43 
 
 
713 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  32.44 
 
 
709 aa  278  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
715 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 
710 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  33.53 
 
 
769 aa  273  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  34.03 
 
 
720 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 
755 aa  271  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  28.94 
 
 
779 aa  270  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  36.06 
 
 
747 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.41 
 
 
756 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  27.25 
 
 
737 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  37.18 
 
 
742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.84 
 
 
784 aa  250  8e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.73 
 
 
778 aa  248  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.63 
 
 
766 aa  248  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.47 
 
 
758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 
739 aa  245  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  36.2 
 
 
763 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.16 
 
 
774 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  28.69 
 
 
753 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.14 
 
 
758 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 
745 aa  240  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 
759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  27.96 
 
 
776 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.97 
 
 
738 aa  234  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  30.03 
 
 
735 aa  233  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.34 
 
 
753 aa  233  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  27.53 
 
 
772 aa  232  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.04 
 
 
737 aa  230  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.02 
 
 
772 aa  226  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  27.3 
 
 
788 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.34 
 
 
737 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
748 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.72 
 
 
756 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1859  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.42 
 
 
804 aa  217  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2194  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.99 
 
 
804 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.07 
 
 
797 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.18 
 
 
779 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 
731 aa  213  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.03 
 
 
770 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2958  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.99 
 
 
759 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0453248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.29 
 
 
745 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.64 
 
 
727 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.6 
 
 
726 aa  207  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
764 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 
751 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.26 
 
 
721 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  26.49 
 
 
756 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.35 
 
 
743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.13 
 
 
789 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.59 
 
 
872 aa  197  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 
711 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 
774 aa  194  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.87 
 
 
782 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 
776 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.28 
 
 
733 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.32 
 
 
701 aa  187  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
750 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
743 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  26.61 
 
 
820 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.1 
 
 
527 aa  171  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  24.87 
 
 
771 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  24.87 
 
 
789 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  29.31 
 
 
718 aa  168  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.76 
 
 
790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 
734 aa  165  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
804 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  26.75 
 
 
790 aa  165  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.83 
 
 
750 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  25.82 
 
 
736 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
735 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  26.72 
 
 
731 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 
795 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.95 
 
 
720 aa  157  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.37 
 
 
722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  26.55 
 
 
755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
696 aa  154  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  29.81 
 
 
464 aa  154  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.54 
 
 
736 aa  153  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 
731 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.88 
 
 
741 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 
740 aa  152  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  29.8 
 
 
746 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.12 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.49 
 
 
739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 
704 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 
741 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  25.04 
 
 
726 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.12 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.15 
 
 
806 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.8 
 
 
732 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>