More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1340 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  100 
 
 
820 aa  1652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.81 
 
 
790 aa  267  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 
804 aa  230  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28.02 
 
 
741 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.02 
 
 
741 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.02 
 
 
741 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 
802 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.15 
 
 
741 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.59 
 
 
741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.76 
 
 
806 aa  220  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.41 
 
 
741 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.28 
 
 
741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  27.16 
 
 
739 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  27.16 
 
 
739 aa  217  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.16 
 
 
739 aa  217  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.36 
 
 
739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  25.03 
 
 
775 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.32 
 
 
747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  24.12 
 
 
772 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.23 
 
 
745 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  26.82 
 
 
746 aa  207  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.38 
 
 
795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.63 
 
 
730 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  196  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.61 
 
 
726 aa  196  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  196  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  196  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  196  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.61 
 
 
726 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.56 
 
 
740 aa  195  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.61 
 
 
726 aa  194  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  24.31 
 
 
784 aa  193  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.24 
 
 
794 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.37 
 
 
743 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.25 
 
 
730 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 
802 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  25.34 
 
 
732 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.99 
 
 
726 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.19 
 
 
734 aa  187  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.16 
 
 
724 aa  187  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  24.17 
 
 
722 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.44 
 
 
736 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.66 
 
 
726 aa  185  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  23.09 
 
 
719 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.96 
 
 
719 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  22.51 
 
 
767 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.18 
 
 
741 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.96 
 
 
719 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.96 
 
 
719 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.96 
 
 
719 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.76 
 
 
759 aa  180  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  23.91 
 
 
783 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  24.4 
 
 
724 aa  180  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.18 
 
 
746 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.49 
 
 
720 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  25.19 
 
 
730 aa  178  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  22.86 
 
 
822 aa  177  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.44 
 
 
736 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.04 
 
 
720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.26 
 
 
720 aa  175  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  24.7 
 
 
734 aa  175  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.11 
 
 
720 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.81 
 
 
727 aa  173  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  25.1 
 
 
786 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 
735 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  22.73 
 
 
796 aa  172  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.45 
 
 
738 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.01 
 
 
720 aa  172  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  24.93 
 
 
723 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.94 
 
 
749 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.01 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.01 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  25.98 
 
 
733 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 
745 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.01 
 
 
720 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  23.01 
 
 
720 aa  171  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  22.89 
 
 
720 aa  171  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.39 
 
 
753 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.3 
 
 
779 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  22.56 
 
 
798 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.09 
 
 
722 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.87 
 
 
723 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  24.58 
 
 
803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  23.11 
 
 
731 aa  165  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 
803 aa  163  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  24.33 
 
 
740 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  24.63 
 
 
746 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  25.16 
 
 
746 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.53 
 
 
755 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.63 
 
 
746 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.19 
 
 
742 aa  160  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  25.37 
 
 
750 aa  160  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 
755 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  22.7 
 
 
753 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  28.01 
 
 
711 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.67 
 
 
721 aa  159  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  26 
 
 
727 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.86 
 
 
759 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 
754 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>