More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1694 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
779 aa  1580    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  50.75 
 
 
772 aa  711    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.87 
 
 
753 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  32.53 
 
 
730 aa  364  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  30.62 
 
 
745 aa  334  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  30.6 
 
 
797 aa  325  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 
727 aa  300  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  29.43 
 
 
737 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.41 
 
 
737 aa  291  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  28.67 
 
 
756 aa  291  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.2 
 
 
743 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  29.93 
 
 
756 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.25 
 
 
721 aa  280  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  28.91 
 
 
738 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.08 
 
 
755 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.79 
 
 
739 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  29.09 
 
 
790 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  27.37 
 
 
711 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  27.31 
 
 
726 aa  244  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.78 
 
 
770 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.32 
 
 
733 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
745 aa  237  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 
804 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 
731 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 
738 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  27.51 
 
 
753 aa  225  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  28.8 
 
 
766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  27.79 
 
 
872 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.77 
 
 
806 aa  218  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  26.39 
 
 
734 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.47 
 
 
778 aa  214  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  31.43 
 
 
472 aa  213  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.32 
 
 
734 aa  211  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  25.9 
 
 
758 aa  208  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.5 
 
 
774 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29.22 
 
 
527 aa  202  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.99 
 
 
736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  25.13 
 
 
758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  30 
 
 
466 aa  198  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  22.78 
 
 
750 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.74 
 
 
756 aa  194  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  35.65 
 
 
464 aa  194  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  25.71 
 
 
772 aa  193  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.61 
 
 
710 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.49 
 
 
739 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  25.65 
 
 
788 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  25.95 
 
 
739 aa  190  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.6 
 
 
741 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26 
 
 
722 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.92 
 
 
720 aa  179  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.87 
 
 
722 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.74 
 
 
575 aa  175  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  26.14 
 
 
763 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.57 
 
 
454 aa  174  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.12 
 
 
790 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  23.69 
 
 
803 aa  171  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.87 
 
 
776 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  37.15 
 
 
505 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.9 
 
 
667 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  25.28 
 
 
795 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  34.97 
 
 
521 aa  163  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.44 
 
 
747 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  41.01 
 
 
217 aa  162  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  34.65 
 
 
529 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.79 
 
 
756 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  27.84 
 
 
786 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.27 
 
 
820 aa  159  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
789 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.4 
 
 
739 aa  158  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  26.09 
 
 
734 aa  157  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.91 
 
 
508 aa  157  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.78 
 
 
496 aa  157  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  24.57 
 
 
772 aa  157  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.76 
 
 
750 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.97 
 
 
742 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  33.23 
 
 
615 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.2 
 
 
815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.3 
 
 
782 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.25 
 
 
720 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.2 
 
 
739 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  39.42 
 
 
246 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.2 
 
 
739 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  26.45 
 
 
726 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  40.55 
 
 
217 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.2 
 
 
739 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
748 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.78 
 
 
745 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.52 
 
 
472 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  28.05 
 
 
741 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.03 
 
 
741 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.91 
 
 
802 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  30.24 
 
 
746 aa  150  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  25.84 
 
 
750 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.32 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.32 
 
 
741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.54 
 
 
235 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  32.76 
 
 
747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0576306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.4 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 
232 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>