More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07230 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  100 
 
 		 815 aa  1659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  46.79 
 
 		 815 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  31.57 
 
 		 786 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  28.65 
 
 		 775 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  26.52 
 
 		 783 aa  306  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  32.25 
 
 		 795 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  26.53 
 
 		 794 aa  290  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30.89 
 
 		 767 aa  286  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.62 
 
 		 802 aa  283  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  26.79 
 
 		 798 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  26.47 
 
 		 800 aa  278  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.75 
 
 		 822 aa  264  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  25.44 
 
 		 772 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  27.21 
 
 		 796 aa  259  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.32 
 
 		 759 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 		 784 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.98 
 
 		 790 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  24.77 
 
 		 753 aa  218  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 804 aa  217  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.25 
 
 		 806 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  24.77 
 
 		 800 aa  174  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.29 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 		 738 aa  172  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.31 
 
 		 720 aa  170  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.04 
 
 		 736 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  22.69 
 
 		 733 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.54 
 
 		 722 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.83 
 
 		 746 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  28.61 
 
 		 721 aa  165  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 		 735 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.7 
 
 		 740 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.94 
 
 		 464 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  22.82 
 
 		 730 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.43 
 
 		 730 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.7 
 
 		 736 aa  161  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.36 
 
 		 741 aa  161  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  28.57 
 
 		 716 aa  160  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.82 
 
 		 745 aa  160  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.62 
 
 		 736 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  24.04 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.32 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.91 
 
 		 759 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.08 
 
 		 755 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  27.83 
 
 		 779 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  23.37 
 
 		 753 aa  158  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.87 
 
 		 726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.65 
 
 		 753 aa  157  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.26 
 
 		 742 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.66 
 
 		 737 aa  156  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.63 
 
 		 726 aa  156  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.86 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.67 
 
 		 721 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.76 
 
 		 719 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  36.55 
 
 		 484 aa  154  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.06 
 
 		 739 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  22.89 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  22.21 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  22.89 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  21.64 
 
 		 755 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  22.98 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 		 740 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.61 
 
 		 575 aa  151  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.66 
 
 		 757 aa  151  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  24.46 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  24.46 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.21 
 
 		 734 aa  151  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.33 
 
 		 743 aa  151  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  24.1 
 
 		 722 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  23.57 
 
 		 727 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.85 
 
 		 736 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.88 
 
 		 719 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.88 
 
 		 719 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.88 
 
 		 719 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  24.26 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.28 
 
 		 739 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.98 
 
 		 719 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  24.46 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  24.26 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  24.26 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  24.06 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  24.26 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.93 
 
 		 767 aa  149  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.44 
 
 		 496 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.35 
 
 		 503 aa  149  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.02 
 
 		 727 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  24.68 
 
 		 756 aa  148  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.17 
 
 		 741 aa  148  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.66 
 
 		 772 aa  147  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 741 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  24.62 
 
 		 746 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.47 
 
 		 740 aa  147  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>