More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3872 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 
720 aa  1471    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.67 
 
 
722 aa  388  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.14 
 
 
739 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.99 
 
 
721 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
737 aa  206  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.9 
 
 
779 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  25.94 
 
 
743 aa  195  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.54 
 
 
755 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 
738 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.6 
 
 
733 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.03 
 
 
753 aa  185  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  27.06 
 
 
774 aa  184  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.3 
 
 
734 aa  180  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.04 
 
 
797 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.61 
 
 
711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.53 
 
 
756 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.99 
 
 
790 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.72 
 
 
756 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
731 aa  164  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  23.57 
 
 
772 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.76 
 
 
726 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.7 
 
 
756 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 
745 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.74 
 
 
737 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  22.85 
 
 
778 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  23.68 
 
 
770 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
759 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 
804 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.63 
 
 
464 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  22.37 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.9 
 
 
750 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.83 
 
 
739 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.47 
 
 
741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28.47 
 
 
741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.47 
 
 
741 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.85 
 
 
742 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.03 
 
 
734 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.47 
 
 
741 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  27.54 
 
 
751 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  25.79 
 
 
734 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23.16 
 
 
710 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.39 
 
 
727 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  24.44 
 
 
766 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.62 
 
 
722 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.97 
 
 
741 aa  138  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.22 
 
 
741 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  24.75 
 
 
776 aa  137  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.12 
 
 
736 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.06 
 
 
736 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.48 
 
 
741 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.91 
 
 
872 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.3 
 
 
738 aa  132  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.3 
 
 
739 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  24.8 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.97 
 
 
708 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.3 
 
 
739 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.41 
 
 
730 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.13 
 
 
739 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.51 
 
 
667 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  24.11 
 
 
790 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.39 
 
 
740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  25.15 
 
 
735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.39 
 
 
806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  35.68 
 
 
217 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.44 
 
 
463 aa  129  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.43 
 
 
217 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.2 
 
 
750 aa  128  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.04 
 
 
575 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  20.75 
 
 
802 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30 
 
 
529 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 
753 aa  127  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.67 
 
 
505 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.97 
 
 
508 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.16 
 
 
789 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.8 
 
 
815 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.4 
 
 
732 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.68 
 
 
482 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.23 
 
 
509 aa  124  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 
745 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  21.97 
 
 
758 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  23.14 
 
 
757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.5 
 
 
726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  24.91 
 
 
755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  28.37 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  24.45 
 
 
814 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.350341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  25.42 
 
 
815 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  31.56 
 
 
503 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.8 
 
 
788 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  21.8 
 
 
758 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  29.22 
 
 
521 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  22.9 
 
 
763 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.42 
 
 
615 aa  120  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  27.38 
 
 
795 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  34.5 
 
 
249 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  31.41 
 
 
624 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  22.41 
 
 
786 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.57 
 
 
484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>