More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3891 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
802 aa  1643    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.73 
 
 
786 aa  325  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  27.66 
 
 
794 aa  296  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  27.03 
 
 
795 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  28.63 
 
 
784 aa  277  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  24.93 
 
 
775 aa  274  5.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  25.56 
 
 
815 aa  271  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  26.34 
 
 
798 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
772 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  26.46 
 
 
796 aa  260  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  25.53 
 
 
767 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 
804 aa  256  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  25.78 
 
 
800 aa  256  9e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  26.72 
 
 
783 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  24.9 
 
 
815 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 
790 aa  244  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  27.59 
 
 
820 aa  221  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.14 
 
 
759 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  24.03 
 
 
767 aa  214  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 
753 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.87 
 
 
822 aa  199  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.86 
 
 
806 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.07 
 
 
736 aa  190  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 
726 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.41 
 
 
754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.24 
 
 
746 aa  185  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  24.4 
 
 
747 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  24.09 
 
 
716 aa  179  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  24.37 
 
 
800 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 
730 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  29.65 
 
 
721 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  21.8 
 
 
734 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.56 
 
 
740 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
738 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  22.34 
 
 
746 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.36 
 
 
739 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 
749 aa  174  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  23.06 
 
 
759 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  26.32 
 
 
735 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  22.21 
 
 
746 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  31.83 
 
 
732 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.41 
 
 
730 aa  171  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.36 
 
 
739 aa  171  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.36 
 
 
739 aa  171  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  22.07 
 
 
746 aa  170  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.47 
 
 
741 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.06 
 
 
739 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  29.47 
 
 
741 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.47 
 
 
741 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  21.97 
 
 
746 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  23.76 
 
 
745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.21 
 
 
741 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  22.36 
 
 
741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  29.21 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  29.21 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.21 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  31.02 
 
 
740 aa  167  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  23.57 
 
 
745 aa  167  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  24.67 
 
 
740 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.8 
 
 
736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23.74 
 
 
748 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  21.58 
 
 
720 aa  165  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.77 
 
 
726 aa  165  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  21.7 
 
 
720 aa  165  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  21.58 
 
 
720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  21.58 
 
 
720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  21.58 
 
 
720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  21.58 
 
 
720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 
721 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.65 
 
 
745 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  21.58 
 
 
720 aa  164  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  21.45 
 
 
720 aa  164  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.56 
 
 
464 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  22.6 
 
 
723 aa  162  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  20.58 
 
 
731 aa  162  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.51 
 
 
726 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.63 
 
 
753 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.51 
 
 
726 aa  161  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.51 
 
 
726 aa  161  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.51 
 
 
726 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.51 
 
 
726 aa  161  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.51 
 
 
726 aa  161  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.51 
 
 
726 aa  161  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.95 
 
 
734 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  23.76 
 
 
745 aa  161  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.74 
 
 
726 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  23.88 
 
 
740 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.57 
 
 
750 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  22.32 
 
 
764 aa  158  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.5 
 
 
746 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.78 
 
 
756 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.29 
 
 
740 aa  157  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.73 
 
 
719 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  22.48 
 
 
747 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  22.92 
 
 
753 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.22 
 
 
719 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  21.86 
 
 
764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.58 
 
 
719 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  28.49 
 
 
734 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.36 
 
 
719 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>