More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2955 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
521 aa  1017    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  78.4 
 
 
529 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  43.61 
 
 
524 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  37.04 
 
 
667 aa  277  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  40.48 
 
 
492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  36.88 
 
 
505 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  39.96 
 
 
463 aa  266  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  37.17 
 
 
508 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  38.34 
 
 
503 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.79 
 
 
466 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  37.89 
 
 
615 aa  250  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.73 
 
 
454 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  40.09 
 
 
525 aa  246  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  35.87 
 
 
497 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  36.68 
 
 
490 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.62 
 
 
472 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  34.41 
 
 
509 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.6 
 
 
496 aa  230  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  37.84 
 
 
443 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  36.15 
 
 
474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  33.84 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.69 
 
 
464 aa  213  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  37.33 
 
 
477 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  35.33 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  36.63 
 
 
492 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  35.42 
 
 
438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  34.34 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  38.6 
 
 
790 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.03 
 
 
730 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.43 
 
 
482 aa  177  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  46 
 
 
235 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 
804 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  33.67 
 
 
732 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  33.64 
 
 
755 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34 
 
 
730 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.49 
 
 
736 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  41.26 
 
 
233 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
740 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  41.26 
 
 
233 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  41.26 
 
 
233 aa  160  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  41.26 
 
 
233 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  41.26 
 
 
233 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  41.26 
 
 
234 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  41.95 
 
 
225 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  41.95 
 
 
225 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  40.49 
 
 
257 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  40.98 
 
 
225 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  38.24 
 
 
217 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  32.26 
 
 
739 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.24 
 
 
217 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  36.14 
 
 
721 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  34.22 
 
 
734 aa  153  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  34.88 
 
 
217 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  30.32 
 
 
802 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 
453 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  34.86 
 
 
779 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  33.44 
 
 
743 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.98 
 
 
225 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  34.75 
 
 
772 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  40.98 
 
 
225 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  34.36 
 
 
806 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.69 
 
 
575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  33.33 
 
 
741 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 
741 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.4 
 
 
756 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  43.4 
 
 
239 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.22 
 
 
739 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.91 
 
 
741 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.33 
 
 
741 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
741 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.15 
 
 
240 aa  147  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  33.33 
 
 
741 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.9 
 
 
741 aa  146  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.09 
 
 
722 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.22 
 
 
739 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  33.22 
 
 
739 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  30.5 
 
 
745 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  33.22 
 
 
739 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  35.03 
 
 
741 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  43.63 
 
 
233 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  40.2 
 
 
246 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  42.5 
 
 
232 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  37.95 
 
 
205 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  35.26 
 
 
774 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  43.14 
 
 
224 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.98 
 
 
230 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.98 
 
 
230 aa  143  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  34.51 
 
 
753 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.97 
 
 
720 aa  141  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  31.25 
 
 
756 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  31.5 
 
 
803 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  31.49 
 
 
747 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  36.08 
 
 
727 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.62 
 
 
220 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  41.97 
 
 
803 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  42.93 
 
 
211 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.77 
 
 
800 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  30.98 
 
 
794 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  31.07 
 
 
746 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.67 
 
 
738 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>