More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2183 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
745 aa  1544    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.9 
 
 
753 aa  351  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  30.39 
 
 
772 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  30.18 
 
 
779 aa  323  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.15 
 
 
743 aa  305  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 
730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  29.44 
 
 
727 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.73 
 
 
721 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
737 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.69 
 
 
797 aa  265  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.73 
 
 
756 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  28.16 
 
 
711 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 
737 aa  237  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  26.01 
 
 
755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.88 
 
 
774 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.09 
 
 
756 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 
790 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
804 aa  220  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.95 
 
 
720 aa  219  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  27.24 
 
 
734 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  26.8 
 
 
726 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
731 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.81 
 
 
739 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  25.5 
 
 
736 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.06 
 
 
734 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  23.56 
 
 
733 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.29 
 
 
738 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.31 
 
 
467 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.19 
 
 
770 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  31.08 
 
 
466 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.22 
 
 
806 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 
741 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.1 
 
 
766 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  29.91 
 
 
472 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.75 
 
 
746 aa  180  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  30.68 
 
 
723 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
772 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.89 
 
 
724 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.85 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.85 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.85 
 
 
739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.27 
 
 
722 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  25.87 
 
 
756 aa  174  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.37 
 
 
464 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.36 
 
 
739 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.87 
 
 
741 aa  172  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  26.72 
 
 
727 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.26 
 
 
527 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.64 
 
 
741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  30.4 
 
 
724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.82 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.82 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  24.64 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.82 
 
 
741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.06 
 
 
758 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  23.65 
 
 
802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  24.46 
 
 
741 aa  164  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  29.69 
 
 
723 aa  163  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  31.68 
 
 
492 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  28.57 
 
 
720 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  22.27 
 
 
710 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.76 
 
 
741 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.53 
 
 
454 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.05 
 
 
730 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  23.51 
 
 
750 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  25.35 
 
 
731 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  23.78 
 
 
758 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 
726 aa  159  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 
745 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  23.82 
 
 
782 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  24.54 
 
 
788 aa  156  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  29.78 
 
 
784 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  27.88 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  29.68 
 
 
746 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.25 
 
 
872 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  29.27 
 
 
741 aa  154  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  27.62 
 
 
719 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  28.29 
 
 
720 aa  154  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  27.62 
 
 
719 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  27.62 
 
 
719 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  28.61 
 
 
720 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  28.61 
 
 
720 aa  153  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  29.66 
 
 
747 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  28.35 
 
 
740 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  27.62 
 
 
719 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  28.61 
 
 
720 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  28.61 
 
 
720 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.43 
 
 
751 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 
732 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  26.42 
 
 
802 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  26.25 
 
 
744 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  28.61 
 
 
720 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  28.53 
 
 
815 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  28.61 
 
 
720 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.71 
 
 
722 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  28.32 
 
 
720 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  32.63 
 
 
508 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.68 
 
 
756 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.24 
 
 
217 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>