More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1464 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 804 aa  1636    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  49.2 
 
 		 790 aa  721    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  43.03 
 
 		 806 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  29.4 
 
 		 745 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.79 
 
 		 746 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  27.38 
 
 		 720 aa  292  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  29.9 
 
 		 747 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  28.83 
 
 		 723 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  28.66 
 
 		 724 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  29.43 
 
 		 749 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  29.66 
 
 		 734 aa  281  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  27.19 
 
 		 720 aa  280  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.44 
 
 		 719 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  29.96 
 
 		 723 aa  277  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.83 
 
 		 719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.83 
 
 		 719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.83 
 
 		 719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  26.43 
 
 		 719 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.44 
 
 		 741 aa  273  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  26.93 
 
 		 746 aa  272  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.76 
 
 		 721 aa  272  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  29.24 
 
 		 802 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  28.89 
 
 		 784 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.68 
 
 		 741 aa  270  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  26.83 
 
 		 734 aa  269  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  27.19 
 
 		 740 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.54 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.84 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.84 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.84 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.22 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  28.32 
 
 		 730 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  29.23 
 
 		 740 aa  262  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  27.5 
 
 		 795 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.64 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  26.53 
 
 		 739 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  26.53 
 
 		 739 aa  260  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  27.32 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.7 
 
 		 743 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  26.41 
 
 		 739 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.85 
 
 		 721 aa  257  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  28.16 
 
 		 751 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.51 
 
 		 736 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  25.92 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.35 
 
 		 780 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  25.95 
 
 		 720 aa  255  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  25.79 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  27.2 
 
 		 747 aa  254  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  25.79 
 
 		 720 aa  253  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  25.65 
 
 		 720 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  32.42 
 
 		 722 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  27.88 
 
 		 759 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  26.82 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.43 
 
 		 740 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  26.81 
 
 		 736 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  25.65 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  25.65 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  26.18 
 
 		 802 aa  251  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.13 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  27.1 
 
 		 784 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  26.69 
 
 		 736 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.4 
 
 		 730 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  25.45 
 
 		 753 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  26.39 
 
 		 798 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  27.16 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  26.09 
 
 		 726 aa  247  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.13 
 
 		 756 aa  247  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  26.28 
 
 		 747 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 730 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  24.94 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 		 727 aa  244  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.65 
 
 		 720 aa  241  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  25.26 
 
 		 783 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  26.5 
 
 		 767 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.04 
 
 		 779 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  27.08 
 
 		 724 aa  237  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  27.38 
 
 		 755 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  27.32 
 
 		 746 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  26.6 
 
 		 740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  25.73 
 
 		 745 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.74 
 
 		 746 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  29.24 
 
 		 734 aa  233  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  27.42 
 
 		 746 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  27.14 
 
 		 753 aa  233  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26.64 
 
 		 740 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  25.64 
 
 		 786 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  27.28 
 
 		 746 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  24.85 
 
 		 748 aa  231  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.05 
 
 		 746 aa  230  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  26.94 
 
 		 745 aa  230  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  39.3 
 
 		 464 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25.63 
 
 		 744 aa  230  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.3 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  26.76 
 
 		 747 aa  228  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  25.97 
 
 		 744 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  27.33 
 
 		 750 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  25.42 
 
 		 794 aa  227  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  27.4 
 
 		 745 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  26.8 
 
 		 745 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>