More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4355 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  54.82 
 
 
783 aa  860    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 
767 aa  1561    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  54.32 
 
 
775 aa  851    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  37.09 
 
 
772 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  37.09 
 
 
795 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  36.23 
 
 
794 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  35.71 
 
 
759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  33.6 
 
 
798 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  30.87 
 
 
784 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  30.76 
 
 
796 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.58 
 
 
786 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  29.31 
 
 
822 aa  322  1.9999999999999998e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  30.01 
 
 
753 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  26.97 
 
 
815 aa  289  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 
815 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  25.32 
 
 
802 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
804 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  27.46 
 
 
790 aa  238  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  26.83 
 
 
800 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  29.25 
 
 
800 aa  224  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.32 
 
 
806 aa  207  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  24.81 
 
 
730 aa  207  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  23.14 
 
 
767 aa  200  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.59 
 
 
723 aa  187  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.94 
 
 
741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.76 
 
 
745 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
345 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  25.12 
 
 
747 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  24.67 
 
 
749 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.88 
 
 
726 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  25.73 
 
 
744 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.02 
 
 
720 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.12 
 
 
734 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 
746 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.59 
 
 
820 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  25.73 
 
 
744 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  20.95 
 
 
716 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  24.93 
 
 
733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.72 
 
 
721 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.43 
 
 
746 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.27 
 
 
719 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.65 
 
 
739 aa  157  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  25.91 
 
 
740 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  23.23 
 
 
736 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.34 
 
 
719 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.47 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.34 
 
 
719 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.11 
 
 
719 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  23.13 
 
 
724 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26.54 
 
 
740 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  21.49 
 
 
744 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  22.5 
 
 
759 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  23.34 
 
 
751 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23.03 
 
 
723 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.64 
 
 
756 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.78 
 
 
730 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.24 
 
 
745 aa  147  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.61 
 
 
739 aa  147  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  21.45 
 
 
753 aa  146  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.61 
 
 
739 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.45 
 
 
734 aa  147  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.06 
 
 
739 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  22.21 
 
 
753 aa  146  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.86 
 
 
730 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  23.1 
 
 
731 aa  144  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.31 
 
 
770 aa  144  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 
730 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  21.79 
 
 
722 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 
724 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.56 
 
 
736 aa  142  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.73 
 
 
753 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.63 
 
 
743 aa  142  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 
727 aa  141  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.02 
 
 
736 aa  140  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.07 
 
 
772 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  23.01 
 
 
803 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  22.06 
 
 
726 aa  138  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  21.51 
 
 
740 aa  138  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  22.95 
 
 
735 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  22.67 
 
 
748 aa  137  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  21.45 
 
 
732 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.37 
 
 
740 aa  137  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  22.65 
 
 
753 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  21.99 
 
 
740 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  27.57 
 
 
722 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.21 
 
 
736 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.59 
 
 
741 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.69 
 
 
726 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.16 
 
 
720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.21 
 
 
741 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.33 
 
 
741 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.49 
 
 
496 aa  134  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.63 
 
 
454 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  22.43 
 
 
755 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  31.85 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  22.82 
 
 
751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  33.56 
 
 
667 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  37.04 
 
 
484 aa  132  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2632  non-specific protein-tyrosine kinase  23.32 
 
 
745 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.405291  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.09 
 
 
797 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>