More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4089 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  100 
 
 		 759 aa  1535    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  35.79 
 
 		 783 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  35.57 
 
 		 775 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  35.71 
 
 		 767 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  33.47 
 
 		 798 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  34.36 
 
 		 772 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  32.23 
 
 		 795 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  33.11 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  31.27 
 
 		 796 aa  385  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.13 
 
 		 822 aa  343  9e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  28.53 
 
 		 753 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  28.98 
 
 		 784 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  28.25 
 
 		 786 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  27.37 
 
 		 800 aa  238  4e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  24.45 
 
 		 815 aa  227  8e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  25.1 
 
 		 815 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  25.58 
 
 		 800 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.14 
 
 		 802 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.33 
 
 		 790 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.71 
 
 		 767 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.69 
 
 		 806 aa  167  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.35 
 
 		 741 aa  159  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.45 
 
 		 726 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.43 
 
 		 345 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.66 
 
 		 720 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  24.46 
 
 		 759 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.72 
 
 		 820 aa  154  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.58 
 
 		 746 aa  151  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.67 
 
 		 730 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.13 
 
 		 716 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  22.04 
 
 		 744 aa  145  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  22.85 
 
 		 734 aa  145  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  21.43 
 
 		 736 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.21 
 
 		 736 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.94 
 
 		 730 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  22.7 
 
 		 744 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.18 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.18 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.18 
 
 		 726 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.98 
 
 		 727 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.45 
 
 		 755 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  23.52 
 
 		 740 aa  137  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 		 753 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  25.27 
 
 		 757 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.94 
 
 		 739 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  23.24 
 
 		 755 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 738 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  25.72 
 
 		 723 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.2 
 
 		 721 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.44 
 
 		 736 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.17 
 
 		 741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.88 
 
 		 743 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.89 
 
 		 745 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  31.91 
 
 		 505 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.97 
 
 		 496 aa  130  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  25.11 
 
 		 719 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  36.22 
 
 		 508 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  23.58 
 
 		 739 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.76 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.76 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.7 
 
 		 737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  22.03 
 
 		 740 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  24.68 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  24.68 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  22.24 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  24.68 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.05 
 
 		 734 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.05 
 
 		 737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.58 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.62 
 
 		 741 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  30.27 
 
 		 721 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.62 
 
 		 454 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.53 
 
 		 741 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.53 
 
 		 741 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.53 
 
 		 741 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  24.2 
 
 		 733 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  23.61 
 
 		 746 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  23.47 
 
 		 745 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  23.61 
 
 		 746 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  24.68 
 
 		 719 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.64 
 
 		 464 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.74 
 
 		 490 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.31 
 
 		 741 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.46 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  23.61 
 
 		 746 aa  125  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.78 
 
 		 740 aa  125  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  23.64 
 
 		 745 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  21.84 
 
 		 750 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  26.84 
 
 		 746 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  22.97 
 
 		 745 aa  124  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  21.92 
 
 		 748 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  26.21 
 
 		 781 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>