More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10723 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  100 
 
 
796 aa  1595    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  33.69 
 
 
822 aa  428  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  33.5 
 
 
783 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  32.53 
 
 
772 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  34.04 
 
 
798 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  31.27 
 
 
759 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  31.61 
 
 
775 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  32.59 
 
 
794 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  32.07 
 
 
795 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  30.86 
 
 
767 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3362  capsular exopolysaccharide family  29 
 
 
753 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  27.55 
 
 
784 aa  304  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  30.31 
 
 
786 aa  300  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2078  capsular exopolysaccharide family  28.71 
 
 
800 aa  293  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.325756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  26.55 
 
 
802 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  27.08 
 
 
815 aa  259  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0846  tyrosine-protein kinase  27.71 
 
 
800 aa  258  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.657131  normal  0.172131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  26.62 
 
 
815 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.08 
 
 
790 aa  249  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.22 
 
 
806 aa  205  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
804 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  23.86 
 
 
745 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  23.37 
 
 
747 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  23.37 
 
 
746 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.39 
 
 
741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.52 
 
 
741 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.99 
 
 
741 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  22.99 
 
 
741 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  22.99 
 
 
741 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  22.62 
 
 
741 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  22.73 
 
 
739 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.7 
 
 
734 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.26 
 
 
741 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.96 
 
 
720 aa  177  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  23.1 
 
 
753 aa  177  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  24.42 
 
 
716 aa  175  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.8 
 
 
746 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  23.88 
 
 
720 aa  174  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  21.86 
 
 
739 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  22.21 
 
 
739 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  21.84 
 
 
739 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  24.09 
 
 
820 aa  172  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  21.65 
 
 
749 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.1 
 
 
726 aa  170  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  23.84 
 
 
721 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1251  non-specific protein-tyrosine kinase  24.09 
 
 
754 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  22.76 
 
 
753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.164924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  23.95 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.95 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
738 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  23.95 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.95 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.34 
 
 
720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.19 
 
 
720 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.95 
 
 
720 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  23.71 
 
 
751 aa  164  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.46 
 
 
736 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  23.67 
 
 
722 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  22.7 
 
 
730 aa  160  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.38 
 
 
736 aa  160  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  21.84 
 
 
747 aa  158  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.96 
 
 
720 aa  158  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
731 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  22.36 
 
 
784 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  26.37 
 
 
727 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.22 
 
 
755 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3132  exopolysaccharide transport protein family  21.61 
 
 
747 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  35.33 
 
 
464 aa  153  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 
740 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  27.16 
 
 
719 aa  151  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.76 
 
 
741 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.54 
 
 
735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0251  non-specific protein-tyrosine kinase  21.88 
 
 
751 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  26.9 
 
 
719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  26.9 
 
 
719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  26.9 
 
 
719 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  29.85 
 
 
721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  21.98 
 
 
746 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  31.33 
 
 
759 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  26.9 
 
 
719 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.84 
 
 
740 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  27.85 
 
 
732 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  21.01 
 
 
748 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.78 
 
 
743 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  28.82 
 
 
723 aa  146  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.74 
 
 
730 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  24.08 
 
 
744 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.46 
 
 
745 aa  145  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.5 
 
 
736 aa  144  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.43 
 
 
756 aa  144  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2664  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.21 
 
 
345 aa  144  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933952  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  21.79 
 
 
802 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.94 
 
 
753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.71 
 
 
726 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  21.51 
 
 
740 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.71 
 
 
726 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.71 
 
 
726 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  22.9 
 
 
767 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.71 
 
 
726 aa  142  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.71 
 
 
726 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>