More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0461 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 737 aa  1513    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  43.57 
 
 		 756 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  38.54 
 
 		 755 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.93 
 
 		 731 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  38.9 
 
 		 726 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  37.85 
 
 		 738 aa  515  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  31.65 
 
 		 770 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  36.96 
 
 		 527 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  26.83 
 
 		 753 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  29.59 
 
 		 872 aa  287  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  29.49 
 
 		 779 aa  286  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  28.29 
 
 		 734 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.82 
 
 		 743 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  28.53 
 
 		 756 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 		 710 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  28.24 
 
 		 708 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  28.51 
 
 		 756 aa  260  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 		 710 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.26 
 
 		 739 aa  256  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.1 
 
 		 710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.74 
 
 		 721 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.25 
 
 		 738 aa  250  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.76 
 
 		 772 aa  250  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 745 aa  249  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.64 
 
 		 727 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  27.84 
 
 		 797 aa  241  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  27.26 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  26.96 
 
 		 745 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  28.4 
 
 		 756 aa  237  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.11 
 
 		 711 aa  236  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  28 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.21 
 
 		 753 aa  225  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.97 
 
 		 774 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  26.54 
 
 		 772 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  27.11 
 
 		 750 aa  220  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.48 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  25.46 
 
 		 733 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 		 710 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 759 aa  211  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.9 
 
 		 737 aa  210  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 748 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  26.54 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.41 
 
 		 790 aa  198  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.6 
 
 		 779 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.64 
 
 		 720 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 782 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.37 
 
 		 806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  32.73 
 
 		 741 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.21 
 
 		 722 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.77 
 
 		 778 aa  174  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  27.18 
 
 		 718 aa  173  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.79 
 
 		 741 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  23.75 
 
 		 788 aa  170  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  24.87 
 
 		 721 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.79 
 
 		 741 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 749 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 751 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 		 764 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.35 
 
 		 739 aa  164  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.22 
 
 		 734 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.47 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.47 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.37 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  26.57 
 
 		 741 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  25.13 
 
 		 766 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  25.67 
 
 		 795 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.29 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  22.69 
 
 		 739 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.29 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.29 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  25.1 
 
 		 748 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  22.82 
 
 		 739 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  22.57 
 
 		 739 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  24.08 
 
 		 789 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.86 
 
 		 794 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.61 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  26.09 
 
 		 709 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  23.79 
 
 		 763 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  23.12 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.47 
 
 		 724 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  25.23 
 
 		 746 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  25.23 
 
 		 746 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  25.23 
 
 		 746 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 785 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.75 
 
 		 464 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.54 
 
 		 730 aa  154  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  24.07 
 
 		 742 aa  154  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  25.93 
 
 		 745 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  25.52 
 
 		 746 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.8 
 
 		 741 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 750 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  31.9 
 
 		 746 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.65 
 
 		 740 aa  151  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  25.65 
 
 		 744 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  36.04 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.04 
 
 		 745 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  27.68 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.81 
 
 		 453 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>