More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0788 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 749 aa  1501    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  27.54 
 
 		 734 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 		 737 aa  180  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.56 
 
 		 756 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.78 
 
 		 756 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.8 
 
 		 750 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.3 
 
 		 721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  24.73 
 
 		 758 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.02 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  29.92 
 
 		 740 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24 
 
 		 756 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.48 
 
 		 732 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.54 
 
 		 755 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  24.74 
 
 		 753 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  24.35 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.47 
 
 		 739 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 745 aa  137  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.12 
 
 		 738 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  29.95 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 759 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.69 
 
 		 737 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  29.95 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.36 
 
 		 772 aa  132  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  29.95 
 
 		 739 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  28.91 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 804 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.8 
 
 		 745 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  28.91 
 
 		 741 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.42 
 
 		 741 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.65 
 
 		 741 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  28.65 
 
 		 741 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  28.65 
 
 		 741 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.25 
 
 		 727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.65 
 
 		 741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.24 
 
 		 726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  24.49 
 
 		 758 aa  128  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.76 
 
 		 770 aa  127  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.27 
 
 		 778 aa  127  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 738 aa  127  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  28.57 
 
 		 745 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  28.3 
 
 		 746 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 731 aa  126  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.61 
 
 		 779 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  28.3 
 
 		 746 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  24.4 
 
 		 734 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.93 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  23.32 
 
 		 789 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  28.35 
 
 		 745 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  28.3 
 
 		 746 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  22.94 
 
 		 782 aa  124  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  26.77 
 
 		 790 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.11 
 
 		 772 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.81 
 
 		 779 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.68 
 
 		 746 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.06 
 
 		 730 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  27.91 
 
 		 527 aa  118  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  27.22 
 
 		 745 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  26.96 
 
 		 746 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  26.76 
 
 		 747 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 735 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  26.64 
 
 		 718 aa  115  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 750 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.67 
 
 		 726 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  24.3 
 
 		 774 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 730 aa  114  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  22.54 
 
 		 756 aa  114  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  27.4 
 
 		 744 aa  114  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 766 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.7 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.61 
 
 		 720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.37 
 
 		 711 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  25.72 
 
 		 789 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  25.72 
 
 		 771 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.77 
 
 		 747 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  21.24 
 
 		 739 aa  108  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.62 
 
 		 788 aa  107  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  29.11 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.49 
 
 		 797 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.1 
 
 		 820 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 726 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  23.92 
 
 		 790 aa  104  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  25.98 
 
 		 741 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2866  exopolysaccharide transporter  27.29 
 
 		 764 aa  104  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  27.9 
 
 		 726 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 		 751 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  23.33 
 
 		 747 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  23.67 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  24.63 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 		 724 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 701 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  24.31 
 
 		 776 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  22.64 
 
 		 806 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 		 734 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  27.02 
 
 		 755 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 		 776 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.58 
 
 		 723 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  21.38 
 
 		 740 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>