More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5885 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
751 aa  1473    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  35.58 
 
 
756 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.35 
 
 
779 aa  354  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.99 
 
 
745 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  31.18 
 
 
772 aa  343  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.82 
 
 
748 aa  340  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  32.48 
 
 
782 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.63 
 
 
739 aa  328  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  30.83 
 
 
758 aa  324  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  30.59 
 
 
758 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 
750 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  30.83 
 
 
753 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.94 
 
 
764 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  30.25 
 
 
778 aa  289  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  29.88 
 
 
788 aa  287  5e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  30.32 
 
 
756 aa  271  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  29.55 
 
 
776 aa  268  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  31.15 
 
 
790 aa  263  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  31.51 
 
 
734 aa  262  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  29.59 
 
 
789 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  28.17 
 
 
750 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  29.92 
 
 
771 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  29.89 
 
 
789 aa  237  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  30.18 
 
 
710 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.97 
 
 
738 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
737 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
759 aa  211  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.89 
 
 
756 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.63 
 
 
785 aa  204  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 
730 aa  196  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.27 
 
 
755 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
743 aa  190  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.57 
 
 
726 aa  184  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.89 
 
 
756 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  28.26 
 
 
745 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
731 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  29.76 
 
 
764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  31.71 
 
 
735 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.72 
 
 
701 aa  160  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
738 aa  160  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 
721 aa  160  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.04 
 
 
707 aa  159  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  27.93 
 
 
688 aa  159  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.03 
 
 
707 aa  157  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.75 
 
 
779 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.58 
 
 
753 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
770 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 
728 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  28.89 
 
 
773 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.83 
 
 
491 aa  153  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.69 
 
 
872 aa  151  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.72 
 
 
711 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
724 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.7 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 
687 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  25.25 
 
 
727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  26.83 
 
 
713 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.72 
 
 
696 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  27.33 
 
 
769 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 
595 aa  142  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1157  exopolysaccharide transport protein family  28.92 
 
 
720 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.238721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  27.21 
 
 
742 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  27.8 
 
 
572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  26.82 
 
 
715 aa  138  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.62 
 
 
774 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  27.8 
 
 
572 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  27.1 
 
 
747 aa  137  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.85 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.64 
 
 
784 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 
766 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
735 aa  134  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 
733 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
537 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 
790 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.22 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  24.83 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36.27 
 
 
496 aa  128  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.34 
 
 
734 aa  128  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 
478 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6432  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.04 
 
 
734 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.57 
 
 
737 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.44 
 
 
454 aa  124  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
749 aa  124  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.56 
 
 
806 aa  122  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  25.44 
 
 
709 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.77 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  25.61 
 
 
737 aa  117  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
737 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.57 
 
 
720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 
774 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.72 
 
 
820 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  26.49 
 
 
736 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  35.49 
 
 
529 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4353  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.67 
 
 
537 aa  114  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201059  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.19 
 
 
508 aa  114  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  29.67 
 
 
466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  24.37 
 
 
763 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>