More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2644 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  100 
 
 
739 aa  1516    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.46 
 
 
745 aa  505  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.76 
 
 
748 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  40.5 
 
 
753 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  35.12 
 
 
772 aa  475  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  36.4 
 
 
758 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  36.13 
 
 
758 aa  465  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  37.03 
 
 
782 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  38.45 
 
 
756 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.09 
 
 
764 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  33.65 
 
 
776 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.07 
 
 
779 aa  363  9e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 
750 aa  359  9e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  33.33 
 
 
788 aa  346  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  31.99 
 
 
778 aa  340  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  30.79 
 
 
789 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  31.13 
 
 
789 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  31.13 
 
 
771 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  30 
 
 
756 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5885  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 
751 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.912932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 
785 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  28.34 
 
 
790 aa  272  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  26.84 
 
 
750 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.13 
 
 
734 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  26.67 
 
 
738 aa  239  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.58 
 
 
710 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
730 aa  226  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 
701 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.01 
 
 
743 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
737 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  23.64 
 
 
756 aa  201  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1073  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 
728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649181  normal  0.290523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 
738 aa  198  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  25.88 
 
 
737 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.22 
 
 
755 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 
753 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 
731 aa  190  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 
696 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.58 
 
 
779 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  23.04 
 
 
756 aa  187  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.55 
 
 
726 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.67 
 
 
770 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  24.09 
 
 
721 aa  177  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
759 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.77 
 
 
711 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  24.23 
 
 
727 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  24.25 
 
 
764 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  24.86 
 
 
872 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.29 
 
 
772 aa  163  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.47 
 
 
491 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 
491 aa  158  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 
688 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.08 
 
 
736 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3091  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 
784 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00715976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.52 
 
 
734 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  28.04 
 
 
713 aa  149  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.7 
 
 
745 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1008  lipopolysaccharide biosynthesis  29.02 
 
 
687 aa  147  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.597439  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  27.52 
 
 
773 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  28.94 
 
 
572 aa  146  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5050  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 
707 aa  145  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376238  normal  0.397595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.29 
 
 
537 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  25.68 
 
 
527 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4589  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 
707 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.260554 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  28.67 
 
 
572 aa  144  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  27.56 
 
 
715 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.37 
 
 
741 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 
548 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
704 aa  140  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.65 
 
 
478 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
734 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 
734 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
595 aa  138  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.72 
 
 
742 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.58 
 
 
737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5065  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27 
 
 
718 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.66 
 
 
727 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.09 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  27.73 
 
 
769 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.8 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.63 
 
 
776 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  26.95 
 
 
742 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  24.75 
 
 
736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.46 
 
 
726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  23.2 
 
 
774 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  22.63 
 
 
744 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  23.09 
 
 
739 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  23.09 
 
 
739 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 
804 aa  134  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  22.91 
 
 
739 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 
766 aa  132  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  27.53 
 
 
763 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
536 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>