More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1583 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  100 
 
 
737 aa  1484    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  47.38 
 
 
727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  33.88 
 
 
753 aa  381  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  30.81 
 
 
797 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  32.19 
 
 
733 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.69 
 
 
743 aa  302  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  29.85 
 
 
745 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.89 
 
 
730 aa  288  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  29.47 
 
 
779 aa  287  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  29.82 
 
 
772 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.85 
 
 
721 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  27.99 
 
 
756 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
738 aa  238  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  36.09 
 
 
472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.14 
 
 
756 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
731 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  25.17 
 
 
711 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.41 
 
 
774 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 
737 aa  225  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.37 
 
 
755 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.47 
 
 
738 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.07 
 
 
726 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 
467 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 
804 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  31.84 
 
 
466 aa  214  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.59 
 
 
750 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 
734 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.88 
 
 
739 aa  208  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.34 
 
 
790 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.25 
 
 
756 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.02 
 
 
739 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  28.23 
 
 
734 aa  196  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  26.33 
 
 
766 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  25.44 
 
 
710 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.67 
 
 
770 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.08 
 
 
724 aa  190  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  26.46 
 
 
758 aa  190  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  26.56 
 
 
758 aa  190  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  27.76 
 
 
739 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  27.76 
 
 
739 aa  185  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  27.76 
 
 
739 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  27.58 
 
 
739 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0362  capsular exopolysaccharide family  25.23 
 
 
753 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0511737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.77 
 
 
806 aa  183  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.93 
 
 
741 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.96 
 
 
741 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  29.62 
 
 
527 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 
741 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.96 
 
 
741 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  27.96 
 
 
741 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  27.79 
 
 
741 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  27.79 
 
 
741 aa  177  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
745 aa  177  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.79 
 
 
741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.29 
 
 
464 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  25.72 
 
 
782 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  26.56 
 
 
746 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  25.86 
 
 
872 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  22.71 
 
 
736 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  25.67 
 
 
776 aa  171  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.39 
 
 
722 aa  169  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  24.7 
 
 
722 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.76 
 
 
720 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.2 
 
 
744 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  26.2 
 
 
744 aa  168  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.65 
 
 
575 aa  167  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.28 
 
 
726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.17 
 
 
734 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.09 
 
 
732 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  28.48 
 
 
746 aa  163  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.73 
 
 
741 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.05 
 
 
778 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
748 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.32 
 
 
790 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  24.49 
 
 
756 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  26.33 
 
 
740 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.35 
 
 
730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  26.46 
 
 
721 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  26.25 
 
 
746 aa  157  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  26.3 
 
 
751 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  157  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  157  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  157  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  157  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  24.42 
 
 
772 aa  157  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  24.78 
 
 
726 aa  157  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  24.78 
 
 
726 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  24.78 
 
 
726 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  24.17 
 
 
741 aa  155  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  26.36 
 
 
746 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  24.87 
 
 
720 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  26.54 
 
 
746 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  26.54 
 
 
746 aa  155  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  24.52 
 
 
720 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.54 
 
 
745 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  24.52 
 
 
720 aa  153  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 
727 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  26.07 
 
 
747 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3882  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.83 
 
 
779 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.638751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>