More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3012 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 797 aa  1633    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  40.24 
 
 		 753 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  30.6 
 
 		 779 aa  342  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  30.54 
 
 		 772 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  30.56 
 
 		 737 aa  331  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 730 aa  326  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  31.15 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  27.98 
 
 		 743 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.43 
 
 		 756 aa  298  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  29.81 
 
 		 733 aa  280  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.25 
 
 		 745 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  27.96 
 
 		 755 aa  266  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.15 
 
 		 737 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.78 
 
 		 711 aa  260  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 738 aa  257  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25.04 
 
 		 721 aa  251  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.75 
 
 		 756 aa  250  8e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  27.04 
 
 		 770 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  27.13 
 
 		 872 aa  233  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  33.97 
 
 		 472 aa  231  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  25.55 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 		 731 aa  228  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.92 
 
 		 738 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.27 
 
 		 790 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 		 774 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  29.3 
 
 		 466 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.48 
 
 		 734 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 		 467 aa  204  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  26.14 
 
 		 756 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.72 
 
 		 739 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  24.55 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.78 
 
 		 739 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.78 
 
 		 739 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.63 
 
 		 732 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  27.12 
 
 		 766 aa  191  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.8 
 
 		 722 aa  191  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.78 
 
 		 739 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.56 
 
 		 720 aa  189  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  28.4 
 
 		 527 aa  188  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.84 
 
 		 464 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.76 
 
 		 740 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.1 
 
 		 720 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  23.26 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  25.38 
 
 		 735 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  25.5 
 
 		 734 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  24.05 
 
 		 730 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  23.89 
 
 		 723 aa  177  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  23.13 
 
 		 708 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  24.25 
 
 		 747 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.41 
 
 		 746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.02 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  23.84 
 
 		 734 aa  173  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.93 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.43 
 
 		 740 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  23.97 
 
 		 727 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.43 
 
 		 746 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001117  tyrosine-protein kinase wzc  22.19 
 
 		 721 aa  172  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0502594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.57 
 
 		 722 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  23.63 
 
 		 744 aa  170  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  23.79 
 
 		 744 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.49 
 
 		 741 aa  170  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  23 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  24.29 
 
 		 794 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  22.48 
 
 		 722 aa  169  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4764  capsular exopolysaccharide family  23.38 
 
 		 798 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000328255  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  21.95 
 
 		 724 aa  168  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  23 
 
 		 723 aa  168  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  24.96 
 
 		 741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0800  hypothetical protein  24.8 
 
 		 721 aa  167  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  23.51 
 
 		 741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.07 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.45 
 
 		 750 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.29 
 
 		 795 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.91 
 
 		 739 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  32.07 
 
 		 741 aa  164  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.74 
 
 		 719 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.44 
 
 		 492 aa  164  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  23.97 
 
 		 815 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  25.23 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.65 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  24.21 
 
 		 802 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.91 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  25.72 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.62 
 
 		 719 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.62 
 
 		 719 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.19 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  24.19 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  24.19 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  25.64 
 
 		 745 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  22.99 
 
 		 731 aa  161  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2715  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.64 
 
 		 726 aa  161  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.088822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.74 
 
 		 736 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  31.78 
 
 		 741 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.15 
 
 		 624 aa  160  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 		 736 aa  160  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.78 
 
 		 741 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.27 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  23.27 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  23.27 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>